222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0554 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0554  glycoside hydrolase 15-related protein  100 
 
 
578 aa  1180    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000579959  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1322  glycoside hydrolase 15-related  61.84 
 
 
565 aa  758    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.033472  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0989  glycoside hydrolase 15-related  42.49 
 
 
583 aa  498  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.422576  normal  0.0726488 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  44.6 
 
 
584 aa  486  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  31.95 
 
 
868 aa  262  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  30.19 
 
 
599 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  30.2 
 
 
850 aa  256  7e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  30.92 
 
 
611 aa  256  7e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  30.08 
 
 
629 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  30.9 
 
 
605 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  31.47 
 
 
620 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  31.63 
 
 
613 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  31.2 
 
 
612 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 
605 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  29.98 
 
 
598 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  30.32 
 
 
600 aa  252  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  30.41 
 
 
597 aa  250  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  31.6 
 
 
612 aa  250  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  31.3 
 
 
619 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  29.3 
 
 
600 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  30.54 
 
 
606 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  31.13 
 
 
619 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  30.41 
 
 
628 aa  246  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  29.04 
 
 
602 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  29.4 
 
 
586 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  30.39 
 
 
629 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  30.44 
 
 
627 aa  244  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  28.81 
 
 
602 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  30.92 
 
 
625 aa  243  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  30.7 
 
 
869 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  30.61 
 
 
613 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  29.24 
 
 
617 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  30.27 
 
 
598 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  30.02 
 
 
613 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  30.43 
 
 
602 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  30.34 
 
 
609 aa  240  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  29.57 
 
 
605 aa  240  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  30.05 
 
 
589 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  29.59 
 
 
621 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  28.28 
 
 
605 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  29.14 
 
 
617 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  29.72 
 
 
598 aa  239  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  30.19 
 
 
599 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  28.5 
 
 
598 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  28.21 
 
 
602 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  30 
 
 
610 aa  238  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  30.07 
 
 
608 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  30.15 
 
 
595 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  29.07 
 
 
626 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17860  glycosyl hydrolase, glucoamylase  28.37 
 
 
627 aa  237  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  29.95 
 
 
602 aa  237  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  30.29 
 
 
600 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  29.88 
 
 
609 aa  236  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  29.41 
 
 
677 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  29.71 
 
 
611 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  29.41 
 
 
677 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  30.12 
 
 
609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  29.05 
 
 
601 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  29.12 
 
 
599 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  30.12 
 
 
609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  30.47 
 
 
609 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  29.7 
 
 
627 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  27.75 
 
 
636 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  30.12 
 
 
609 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  31.44 
 
 
614 aa  232  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3877  glycoside hydrolase 15-related  29.39 
 
 
668 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929233  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  29.08 
 
 
677 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  31.13 
 
 
619 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  29.67 
 
 
612 aa  231  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  29.49 
 
 
623 aa  230  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  30.22 
 
 
626 aa  230  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  29.82 
 
 
608 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  30.12 
 
 
601 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  29.21 
 
 
659 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  28.64 
 
 
596 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  30.37 
 
 
626 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1144  glycoside hydrolase 15-related protein  26.71 
 
 
696 aa  227  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  28.62 
 
 
604 aa  227  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  30.2 
 
 
596 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  29.07 
 
 
608 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  29.41 
 
 
601 aa  226  9e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  27.91 
 
 
645 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  29.47 
 
 
623 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  28.97 
 
 
609 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  30.05 
 
 
665 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  29.8 
 
 
610 aa  223  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  28.94 
 
 
636 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  29.64 
 
 
601 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  29.78 
 
 
610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  30.92 
 
 
629 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 
610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  28.42 
 
 
593 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  29.78 
 
 
610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  29.78 
 
 
610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  29.78 
 
 
610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  29.78 
 
 
610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  29.78 
 
 
610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  28.55 
 
 
679 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  29.61 
 
 
616 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  34.53 
 
 
643 aa  221  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>