More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0539 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0539  aminotransferase class-III  100 
 
 
440 aa  892    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  40.55 
 
 
457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2930  aminotransferase class-III  38.99 
 
 
460 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1048  aminotransferase class-III  39.07 
 
 
462 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3950  aminotransferase class-III  38.05 
 
 
452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3784  aminotransferase class-III  40.05 
 
 
460 aa  311  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4054  aminotransferase  39.53 
 
 
540 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  37.85 
 
 
428 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  35.83 
 
 
459 aa  290  3e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0662  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  37.53 
 
 
462 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00898604  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  38.5 
 
 
444 aa  289  9e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.65 
 
 
464 aa  286  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.987457  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3329  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.28 
 
 
456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.225117  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3932  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.47 
 
 
470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1806  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.59 
 
 
484 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000212834  normal  0.0412084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2846  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.95 
 
 
469 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33500  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.73 
 
 
469 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366116  normal  0.0316794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2839  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  35.17 
 
 
493 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000267861  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2136  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  35.24 
 
 
488 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.558173  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  42.89 
 
 
430 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  38.85 
 
 
418 aa  280  5e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0412  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.13 
 
 
465 aa  279  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.481167  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1743  4-aminobutyrate aminotransferase  37.1 
 
 
447 aa  279  7e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2583  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.21 
 
 
458 aa  279  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406627  hitchhiker  0.00247951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2868  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.55 
 
 
473 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365956  normal  0.0647409 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.5 
 
 
967 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0275  4-aminobutyrate aminotransferase  38.96 
 
 
417 aa  278  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4223  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.59 
 
 
452 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  38.19 
 
 
440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3548  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.35 
 
 
463 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  37.92 
 
 
445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1640  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.12 
 
 
463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  39.01 
 
 
441 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1946  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  35.18 
 
 
470 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0510  4-aminobutyrate aminotransferase  38.27 
 
 
441 aa  271  2e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  41.03 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2713  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  37.68 
 
 
458 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000482772  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  36.41 
 
 
427 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3149  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.68 
 
 
450 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0696  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.68 
 
 
450 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4363  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.51 
 
 
468 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.549644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3790  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.64 
 
 
463 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.755315 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2897  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.68 
 
 
450 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1469  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.68 
 
 
450 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0119  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.68 
 
 
450 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0514  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.68 
 
 
450 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0532  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.68 
 
 
450 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.301998  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2287  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  34.96 
 
 
474 aa  265  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.139987  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0759  4-aminobutyrate aminotransferase  35.99 
 
 
446 aa  265  1e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.174279  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  36.18 
 
 
448 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2419  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.69 
 
 
464 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000791313  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2060  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.64 
 
 
460 aa  263  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00222981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2355  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.64 
 
 
460 aa  263  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0339571  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  37 
 
 
439 aa  260  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  35.11 
 
 
452 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  35.92 
 
 
441 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2679  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  35.27 
 
 
460 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000398425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  35.24 
 
 
436 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  34.42 
 
 
465 aa  256  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  34.8 
 
 
963 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0926  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  34.41 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0888484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  34.8 
 
 
958 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0562  4-aminobutyrate aminotransferase  37.82 
 
 
447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.921583 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  39.45 
 
 
386 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  35 
 
 
454 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  34.48 
 
 
961 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  35 
 
 
454 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  34.73 
 
 
458 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6480  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  36.6 
 
 
456 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0176  4-aminobutyrate aminotransferase  36.43 
 
 
448 aa  251  2e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0769086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  38.32 
 
 
471 aa  251  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  38.44 
 
 
432 aa  249  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  37.69 
 
 
420 aa  249  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  37.44 
 
 
426 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  37.83 
 
 
427 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  35.92 
 
 
446 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  37.19 
 
 
426 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  36.32 
 
 
453 aa  247  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  40.74 
 
 
434 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2619  diaminobutyrate-2-oxoglutarate transaminase  34.72 
 
 
444 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0216574  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  35 
 
 
478 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  36.47 
 
 
440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  36.72 
 
 
419 aa  246  6e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  34.77 
 
 
454 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  35 
 
 
454 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  34.77 
 
 
454 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6164  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  33.85 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  34.77 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  40.25 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  37.31 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  39.11 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  36.23 
 
 
421 aa  243  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  39.85 
 
 
422 aa  243  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2405  aminotransferase class-III  36.74 
 
 
450 aa  243  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  34.46 
 
 
454 aa  243  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  34.88 
 
 
442 aa  242  9e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  36.09 
 
 
450 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  34.51 
 
 
442 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  35.59 
 
 
432 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  37.03 
 
 
425 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>