More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0316 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  100 
 
 
380 aa  785    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  64.01 
 
 
385 aa  485  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  53.89 
 
 
385 aa  432  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  32.88 
 
 
403 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  33.78 
 
 
390 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  34.45 
 
 
385 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  32.37 
 
 
402 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  32.96 
 
 
389 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  32.11 
 
 
402 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  32.11 
 
 
402 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  33.16 
 
 
402 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  31.45 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  31.4 
 
 
390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  31.9 
 
 
383 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  31.68 
 
 
383 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  30.77 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  31.77 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.81 
 
 
382 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  31.65 
 
 
393 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  33.07 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  30.75 
 
 
384 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  30.65 
 
 
402 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  33.79 
 
 
383 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  29.19 
 
 
391 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  30.65 
 
 
402 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  29.69 
 
 
383 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  31.58 
 
 
389 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  30.75 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  28.07 
 
 
383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  32.03 
 
 
389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  30.53 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  31.88 
 
 
381 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  31.44 
 
 
384 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  32.38 
 
 
390 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  30.77 
 
 
389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  29.79 
 
 
394 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  28.88 
 
 
388 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  31.53 
 
 
390 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  32.55 
 
 
388 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  31.02 
 
 
390 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  29.95 
 
 
403 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  31.03 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  28.9 
 
 
381 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  28.97 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  30.97 
 
 
381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  30.05 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  30.07 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  31.65 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  32.43 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  30.47 
 
 
396 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  30.09 
 
 
385 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  31.38 
 
 
382 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  27.47 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  29.44 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  28 
 
 
380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  32.12 
 
 
388 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  27.62 
 
 
379 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  27.9 
 
 
379 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  30.72 
 
 
384 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  30.81 
 
 
391 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.53 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.87 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  27.62 
 
 
379 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  30.15 
 
 
382 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  30.21 
 
 
391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  30.4 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.24 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  29.41 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  29.52 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  29.47 
 
 
395 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  35.12 
 
 
393 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  29.62 
 
 
395 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  28.22 
 
 
453 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  26.88 
 
 
379 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  28.42 
 
 
396 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  27.95 
 
 
404 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  30.14 
 
 
389 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  26.87 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  26.65 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  28.18 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  29.38 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34.29 
 
 
394 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  27.22 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  29.44 
 
 
389 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.85 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  30 
 
 
389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  29.11 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  27.3 
 
 
389 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4069  putative thiolase  26.84 
 
 
372 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.655327  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  26.93 
 
 
393 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3972  thiolase  25.27 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  26.65 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3322  thiolase  25.27 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00152041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  29.79 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  27.68 
 
 
390 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  31.42 
 
 
390 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  27.3 
 
 
394 aa  110  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  27.86 
 
 
387 aa  109  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3952  putative thiolase  27.52 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.130005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  27.49 
 
 
392 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>