237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0277 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  100 
 
 
615 aa  1261    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  38.39 
 
 
668 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  36.72 
 
 
670 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  36.92 
 
 
663 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  35.51 
 
 
647 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  35.99 
 
 
650 aa  352  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  33.85 
 
 
645 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  32.06 
 
 
649 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.45 
 
 
569 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  32.9 
 
 
615 aa  306  6e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0134624 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  32.23 
 
 
622 aa  292  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  27.19 
 
 
644 aa  214  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  26.57 
 
 
644 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  28.01 
 
 
604 aa  178  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  25.54 
 
 
621 aa  161  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  25.35 
 
 
627 aa  160  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  25.38 
 
 
621 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  25.43 
 
 
621 aa  157  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  25.99 
 
 
673 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  26.77 
 
 
647 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  24.54 
 
 
642 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  25.7 
 
 
611 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  24.31 
 
 
621 aa  148  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0566  glycoside hydrolase 15-related protein  26.91 
 
 
584 aa  99.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.941265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  24.44 
 
 
611 aa  94.7  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  24.28 
 
 
602 aa  89.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  24.64 
 
 
609 aa  89  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  24.4 
 
 
609 aa  88.6  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  24.28 
 
 
609 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  24.22 
 
 
599 aa  88.2  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  24.28 
 
 
609 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  24.28 
 
 
609 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  22.39 
 
 
363 aa  87.4  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  24.34 
 
 
611 aa  87  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  24.34 
 
 
609 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  24.11 
 
 
610 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 
610 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  24.11 
 
 
610 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  24.11 
 
 
610 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  24.11 
 
 
610 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  24.11 
 
 
610 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  24.11 
 
 
610 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  25.84 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  25.99 
 
 
610 aa  81.3  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  24.82 
 
 
645 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  24.32 
 
 
622 aa  81.3  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  23.37 
 
 
621 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  21.49 
 
 
870 aa  80.5  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  23.68 
 
 
601 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  23.87 
 
 
665 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2413  glycoside hydrolase 15-related  26.36 
 
 
412 aa  80.1  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  23.25 
 
 
636 aa  78.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  24.75 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.94 
 
 
1505 aa  78.2  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  24.35 
 
 
598 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2647  Glucoamylase and related glycosyl hydrolase- like protein  24.63 
 
 
683 aa  77.8  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  22.47 
 
 
727 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  24.02 
 
 
598 aa  77.4  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  23.54 
 
 
597 aa  77  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  24.67 
 
 
626 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0545  glucan 14-alpha-glucosidase  26.1 
 
 
734 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495812  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.73 
 
 
821 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  24.15 
 
 
605 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0219  glycoside hydrolase 15-related  23.68 
 
 
402 aa  76.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0997463  hitchhiker  0.0053447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  24.08 
 
 
605 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.86 
 
 
777 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  23.28 
 
 
626 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  24.24 
 
 
595 aa  74.3  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  24.07 
 
 
592 aa  74.3  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  22.85 
 
 
623 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.2 
 
 
858 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  24.88 
 
 
586 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.2 
 
 
858 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  24.08 
 
 
596 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.2 
 
 
841 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.02 
 
 
837 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  23.39 
 
 
602 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  23.96 
 
 
838 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  22.11 
 
 
623 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3484  glycoside hydrolase 15-related  23.89 
 
 
677 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267768  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  22.33 
 
 
592 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  23.91 
 
 
597 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3547  glycoside hydrolase 15-related  23.89 
 
 
677 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.2 
 
 
858 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  22.33 
 
 
592 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  22.55 
 
 
597 aa  70.5  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  23.53 
 
 
604 aa  70.5  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5241  glycoside hydrolase 15-related  23.4 
 
 
679 aa  70.5  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  22.03 
 
 
610 aa  69.7  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  24.07 
 
 
627 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3497  glycoside hydrolase 15-related protein  23.65 
 
 
677 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83213  normal  0.993865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  24.51 
 
 
599 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  22.73 
 
 
608 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  21.61 
 
 
801 aa  69.3  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2670  glycoside hydrolase 15-related protein  23.63 
 
 
659 aa  69.3  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.62 
 
 
840 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  24.24 
 
 
593 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  24.82 
 
 
629 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0554  glycoside hydrolase 15-related protein  24.03 
 
 
578 aa  68.9  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000579959  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  22.84 
 
 
629 aa  68.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>