68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0235 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
139 aa  276  7e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.548712  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  59.29 
 
 
141 aa  163  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.42 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.17 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.97 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.45 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  30.22 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.07 
 
 
212 aa  60.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.57 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  26.62 
 
 
980 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  25.34 
 
 
232 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  25.9 
 
 
1012 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.53 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  25.74 
 
 
1012 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  22.79 
 
 
1019 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.9 
 
 
198 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.87 
 
 
222 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.21 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  26.39 
 
 
987 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  26.39 
 
 
988 aa  55.1  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.86 
 
 
983 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.7 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.304231 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0478  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.26 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.49685  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.91 
 
 
151 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.91 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.66 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  27.66 
 
 
997 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.13 
 
 
254 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  26.57 
 
 
991 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  22.14 
 
 
1011 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  22.14 
 
 
1011 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.39 
 
 
246 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.66 
 
 
204 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.48 
 
 
269 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.63 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.46 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  19.86 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.78 
 
 
243 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1176  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.551592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.46 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  19.05 
 
 
147 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  20.57 
 
 
185 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.14 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.21 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.92 
 
 
193 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.91 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.91 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  22.38 
 
 
200 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  22.54 
 
 
221 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0569  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.69 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0217411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  16.33 
 
 
237 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.02 
 
 
225 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.71 
 
 
220 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  26.81 
 
 
262 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.14 
 
 
223 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.13 
 
 
251 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  21.67 
 
 
213 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.36 
 
 
197 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  22.76 
 
 
155 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  22.14 
 
 
206 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  26.05 
 
 
988 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.73 
 
 
187 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.53 
 
 
202 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.39 
 
 
224 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.39 
 
 
224 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.01 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1350  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.71 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.31 
 
 
213 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>