20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0209 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0209  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  754    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0618  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  48.74 
 
 		 391 aa  324  2e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.873609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  23.78 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4866  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  22.95 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2943  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4462  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.510043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1790  putative sodium ABC transporter permease protein  21.56 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 		 368 aa  47  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0394  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03077  putative ABC-type Na+ efflux pump, permease component  23.75 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1565  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000580039  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0055  transport protein, putative  20.48 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  21.08 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02800  ABC transporter sodium permease  24.35 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>