38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0185 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  100 
 
 		 189 aa  371  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  55.81 
 
 		 178 aa  194  8.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  39.1 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  41.88 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  42.65 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  43.65 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  42.86 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  42.86 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  42.86 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  34.9 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  40.68 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  45.61 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  35 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  34.38 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  38.4 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  40 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  36.91 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  36.54 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  38.14 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  39.84 
 
 		 184 aa  98.2  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  37.12 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  33.11 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  43.22 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  30.59 
 
 		 180 aa  95.1  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  37.33 
 
 		 180 aa  94.7  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  37.58 
 
 		 179 aa  91.3  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  35.9 
 
 		 190 aa  88.6  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  33.33 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  37.17 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  36.36 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  31.67 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  26 
 
 		 415 aa  48.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05785  Pre-rRNA-processing protein pno1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Z5]  31.82 
 
 		 258 aa  45.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250915  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05860  chaperone, putative  30.09 
 
 		 266 aa  45.1  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  30.82 
 
 		 540 aa  43.5  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  27.38 
 
 		 358 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  24.21 
 
 		 356 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  22.22 
 
 		 379 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>