120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0093 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  996    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  61.87 
 
 		 497 aa  682    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  28.83 
 
 		 623 aa  71.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  30.41 
 
 		 758 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  23.69 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  29.61 
 
 		 650 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.68 
 
 		 548 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  27.33 
 
 		 588 aa  57  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  23.01 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  26.58 
 
 		 584 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.3 
 
 		 672 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  22.92 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  31.58 
 
 		 566 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  24.55 
 
 		 349 aa  53.9  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  24.6 
 
 		 585 aa  53.5  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  28.57 
 
 		 553 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4992  hypothetical protein  34.38 
 
 		 380 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  25.15 
 
 		 594 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  25.16 
 
 		 600 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  29.71 
 
 		 598 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  26.34 
 
 		 666 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  29.76 
 
 		 680 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  25.9 
 
 		 369 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  28.23 
 
 		 448 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  20.72 
 
 		 356 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.21 
 
 		 637 aa  51.2  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  28.23 
 
 		 448 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  26.2 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.96 
 
 		 613 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  23.45 
 
 		 593 aa  50.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  33.33 
 
 		 352 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.77 
 
 		 708 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  33.33 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  23.53 
 
 		 596 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  23.49 
 
 		 661 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  24.34 
 
 		 695 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1567  AAA ATPase  27.03 
 
 		 556 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  24.18 
 
 		 976 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  27.38 
 
 		 594 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.81 
 
 		 640 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  20.67 
 
 		 411 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  36.62 
 
 		 276 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  26.32 
 
 		 676 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  31.65 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  32.5 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  34.29 
 
 		 361 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  19.72 
 
 		 564 aa  47  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  30.65 
 
 		 569 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.07 
 
 		 603 aa  47  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  21.08 
 
 		 645 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  19.72 
 
 		 615 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0138  recombination protein F  34.29 
 
 		 358 aa  46.6  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  25.71 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  23.64 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.48 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  25.84 
 
 		 613 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.74 
 
 		 594 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  25.24 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 544 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  23.28 
 
 		 681 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0034  recombination protein F  23.78 
 
 		 361 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000927918  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0681  hypothetical protein  32.86 
 
 		 619 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.27 
 
 		 626 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  32.65 
 
 		 628 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  41.67 
 
 		 496 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  30.86 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  30.19 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1094  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.62 
 
 		 332 aa  45.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  28.74 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  28.81 
 
 		 572 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  29.01 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  24.68 
 
 		 669 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  20.17 
 
 		 341 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  30.61 
 
 		 457 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  24.82 
 
 		 682 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  21.82 
 
 		 356 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.03 
 
 		 652 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0602  ABC transporter related protein  32 
 
 		 539 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.81 
 
 		 616 aa  44.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0003  DNA replication and repair protein  26.26 
 
 		 357 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0109066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  19.43 
 
 		 607 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.17 
 
 		 639 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0003  DNA replication and repair protein RecF  26.26 
 
 		 357 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167718  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1118  hypothetical protein  27.07 
 
 		 419 aa  44.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.146528  hitchhiker  0.0000000167216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  27.14 
 
 		 399 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.36 
 
 		 634 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0003  recombination protein F  23.08 
 
 		 361 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0110624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  30.67 
 
 		 429 aa  44.3  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  44.9 
 
 		 409 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  22.01 
 
 		 674 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  32.94 
 
 		 619 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  32.94 
 
 		 441 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  31.82 
 
 		 369 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  34.62 
 
 		 513 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  41.3 
 
 		 370 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  21.91 
 
 		 349 aa  43.9  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4151  recombination protein F  23.08 
 
 		 361 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000332755  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  22.54 
 
 		 355 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4175  recombination protein F  23.08 
 
 		 361 aa  43.9  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0239408  normal  0.0132322 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>