More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0068 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  100 
 
 		 864 aa  1672    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  32.66 
 
 		 858 aa  365  3e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  27.84 
 
 		 993 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  27.53 
 
 		 993 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  27.15 
 
 		 891 aa  172  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.65 
 
 		 993 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  23.66 
 
 		 994 aa  168  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  25.43 
 
 		 702 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  24.1 
 
 		 895 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  22.56 
 
 		 924 aa  136  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  25.82 
 
 		 804 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  23 
 
 		 891 aa  130  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  23.58 
 
 		 702 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  26.17 
 
 		 802 aa  118  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  23.27 
 
 		 702 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  23.24 
 
 		 926 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  22.4 
 
 		 984 aa  111  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  24.62 
 
 		 935 aa  107  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  23.42 
 
 		 890 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  32.16 
 
 		 1019 aa  103  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  23.5 
 
 		 1061 aa  103  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  21.95 
 
 		 1021 aa  103  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  23.31 
 
 		 789 aa  98.6  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  27.16 
 
 		 693 aa  97.8  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  21.65 
 
 		 1008 aa  97.8  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  22.23 
 
 		 1057 aa  97.4  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  21.87 
 
 		 1019 aa  97.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  24 
 
 		 805 aa  96.7  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  22.71 
 
 		 700 aa  89  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  20.29 
 
 		 795 aa  88.2  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  22.2 
 
 		 859 aa  85.9  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  21.77 
 
 		 813 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  23.1 
 
 		 784 aa  82.8  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  26.24 
 
 		 1074 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  24.2 
 
 		 961 aa  79  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  24.74 
 
 		 1008 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  24.56 
 
 		 1008 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  25.43 
 
 		 852 aa  75.1  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  25.43 
 
 		 852 aa  75.1  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  20.91 
 
 		 906 aa  71.6  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  23.04 
 
 		 857 aa  70.5  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  22.95 
 
 		 1146 aa  70.1  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  0.00000500177 
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  22.02 
 
 		 859 aa  67.4  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  30.77 
 
 		 978 aa  66.6  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  20.31 
 
 		 1031 aa  65.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  22.45 
 
 		 1007 aa  65.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  24.02 
 
 		 902 aa  65.1  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  19.27 
 
 		 794 aa  65.1  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  23.05 
 
 		 814 aa  63.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  22.87 
 
 		 790 aa  63.5  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  28.28 
 
 		 1003 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  27.06 
 
 		 1153 aa  62.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  37.18 
 
 		 922 aa  62.4  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  35.24 
 
 		 888 aa  62  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  21.92 
 
 		 1016 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53629  DNA repair protein  23.03 
 
 		 1306 aa  61.2  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.440366 
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  35 
 
 		 1125 aa  59.3  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0475  ABC transporter-related protein  43.59 
 
 		 228 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.761135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1750  SMC domain protein  22.83 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.524117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0441  ABC transporter, ATPase subunit  43.59 
 
 		 228 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123309  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18310  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydD  40.3 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.58 
 
 		 1170 aa  58.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0470  ABC transporter related  43.59 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0275  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  34.19 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.994335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  26.17 
 
 		 912 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5887  ABC transporter related  38.82 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1099  ABC transporter related  33.33 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  24.39 
 
 		 910 aa  57.8  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  22.21 
 
 		 1059 aa  57.8  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 		 1234 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0445  ABC transporter, ATP-binding protein  38.37 
 
 		 232 aa  57.4  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0757  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  36.47 
 
 		 236 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51876  Rad50 DNA repair/recombination protein  23.04 
 
 		 1436 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2079  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 		 218 aa  57.4  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  43.66 
 
 		 641 aa  57.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  35 
 
 		 628 aa  57  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0968  ABC transporter related  39.74 
 
 		 254 aa  57.4  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0806647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  42.67 
 
 		 483 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07870  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  30.84 
 
 		 223 aa  57.4  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.995675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  26.4 
 
 		 371 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0407  ABC transporter related  38.96 
 
 		 235 aa  56.2  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0147  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 232 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1033  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 232 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  38.75 
 
 		 241 aa  57  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1792  ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 233 aa  56.6  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  34.07 
 
 		 1193 aa  56.6  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  22.47 
 
 		 1029 aa  56.2  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1318  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 234 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  23.52 
 
 		 1171 aa  56.2  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2768  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 234 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2625  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 234 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0173  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 234 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4230  phosphonate C-P lyase system protein PhnL  36.78 
 
 		 235 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  25.26 
 
 		 1007 aa  56.2  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  30 
 
 		 530 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  21.55 
 
 		 1022 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  41.46 
 
 		 262 aa  55.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  37.18 
 
 		 1063 aa  56.2  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03619  subunit of MRX complex (Eurofung)  37.36 
 
 		 1319 aa  55.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.296767 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0941  peptide ABC transporter ATPase  36.05 
 
 		 220 aa  55.5  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>