13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0058 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0058  BPS2 protein-like protein  100 
 
 		 587 aa  1153    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0769  SMC domain-containing protein  50.08 
 
 		 619 aa  565  1.0000000000000001e-159  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0350416 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4125  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  26.48 
 
 		 655 aa  80.9  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2048  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  24.46 
 
 		 647 aa  76.6  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3954  Chromosome segregation ATPase-like protein  23.2 
 
 		 601 aa  70.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2908  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  34.19 
 
 		 661 aa  60.5  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4414  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  22.36 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  25.5 
 
 		 702 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2244  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  23.48 
 
 		 642 aa  53.9  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.182802 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4714  Chromosome segregation ATPase-like protein  24.62 
 
 		 645 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  25.73 
 
 		 1174 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0820  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  27.07 
 
 		 653 aa  44.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.32 
 
 		 1476 aa  43.9  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>