More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0055 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 216 aa  440  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  58.17 
 
 		 205 aa  256  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.84 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  31.87 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.96 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.18 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.47 
 
 		 442 aa  68.6  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  30.77 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  32.53 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  25.63 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  30.11 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  25.54 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  27.23 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  29.94 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  29.75 
 
 		 183 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_54920  predicted protein  25.74 
 
 		 309 aa  62  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  25 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1314  phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  28.07 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.17 
 
 		 443 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  29.17 
 
 		 383 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  37.04 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  27.09 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  24.73 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  24.73 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  26.94 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  26.58 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9413  hypothetical protein  29.87 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.66 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.08 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  28.37 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  29.82 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  26.38 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  24.02 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  24.39 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  26 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2350  phosphoglycerate mutase  24.24 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  26.84 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  27.63 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  27.67 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>