89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4458 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
134 aa  277  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  77.44 
 
 
134 aa  224  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  72.87 
 
 
134 aa  207  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  67.91 
 
 
134 aa  202  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  67.16 
 
 
135 aa  197  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  62.69 
 
 
136 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  62.69 
 
 
136 aa  192  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  62.69 
 
 
136 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  62.69 
 
 
136 aa  192  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  62.69 
 
 
136 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  63.16 
 
 
138 aa  190  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  61.94 
 
 
136 aa  190  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  61.94 
 
 
136 aa  189  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  61.94 
 
 
136 aa  189  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  60.9 
 
 
155 aa  183  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  66.94 
 
 
132 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  48.8 
 
 
133 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  50.86 
 
 
139 aa  134  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  45.16 
 
 
131 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  45.16 
 
 
136 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  41.27 
 
 
147 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 
137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  41.27 
 
 
135 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  41.27 
 
 
135 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  41.27 
 
 
135 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  40.65 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  39.37 
 
 
135 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
133 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  26.43 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  24.59 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  27.27 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  28.46 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0817  thioesterase family protein  30.77 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0988  thioesterase family protein  30.77 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0576476  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
162 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  23.2 
 
 
283 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1045  thioesterase family protein  28.57 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  24.58 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  27.47 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1972  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  25.88 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  26.12 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  26.12 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  26.12 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  26.12 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  26.12 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  24.81 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  26.12 
 
 
143 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  25.44 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  25.2 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
149 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>