49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4452 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4452  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  806    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4845  hypothetical protein  69.76 
 
 		 395 aa  544  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4179  hypothetical protein  67.99 
 
 		 403 aa  512  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3769  hypothetical protein  67.6 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3965  hypothetical protein  60.42 
 
 		 401 aa  481  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0086  hypothetical protein  66.19 
 
 		 412 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0075  hypothetical protein  48.72 
 
 		 400 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0079  hypothetical protein  39.63 
 
 		 158 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2307  putative esterase  26.04 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1563  putative esterase  24.63 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.476528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1530  putative esterase  24.63 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000509673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2821  putative esterase  24.05 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000598865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1819  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6036  putative esterase  24.73 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000538936  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2737  putative esterase  24.56 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2109  putative esterase  22.68 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000499047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2563  putative esterase  23.68 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2630  putative esterase  22.81 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01445  putative esterase  25.21 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.676403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1518  putative esterase  25.27 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1862  putative esterase  25.52 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1813  putative esterase  25.5 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2437  putative esterase  26.52 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2349  putative esterase  26.52 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.705233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0827  putative esterase  26.95 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0711  putative esterase  24.77 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000350604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  22.69 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3542  putative esterase  23.96 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0209702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3504  putative esterase  31.31 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3025  hypothetical protein  23.29 
 
 		 330 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1514  putative esterase  22.87 
 
 		 351 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00321061  normal  0.816657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2868  cysteine synthase A  22.78 
 
 		 309 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.965819  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0737  putative esterase  27.89 
 
 		 437 aa  49.7  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0619  putative esterase  28.32 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4960  putative esterase  21.53 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2988  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.37 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000107918 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2088  putative esterase  27.27 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1535  putative esterase  24.75 
 
 		 232 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6478  esterase  33.01 
 
 		 293 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1666  putative esterase  22.69 
 
 		 445 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0598325  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3112  putative esterase  28.81 
 
 		 280 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127997  normal  0.511793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2146  putative esterase  26.42 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21170  esterase  30.91 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4375  putative esterase  37.1 
 
 		 288 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.649215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3040  putative esterase  23.86 
 
 		 291 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91008 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3111  putative esterase  36.36 
 
 		 312 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.597643  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4516  putative esterase  35.29 
 
 		 422 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0079  hypothetical protein  32.43 
 
 		 298 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0868984  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1825  putative esterase  34.43 
 
 		 276 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  0.167809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>