182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4447 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5033  urocanate hydratase  76.65 
 
 		 557 aa  874    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4138  urocanate hydratase  74.82 
 
 		 568 aa  858    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13459  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0629  urocanate hydratase  61.75 
 
 		 552 aa  707    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.317757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2647  urocanate hydratase  66.16 
 
 		 601 aa  798    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.147461  normal  0.780355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3679  urocanate hydratase  64.95 
 
 		 552 aa  742    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0909  urocanate hydratase  84.5 
 
 		 564 aa  967    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0932  urocanate hydratase  73.24 
 
 		 557 aa  828    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0097  urocanate hydratase  89.37 
 
 		 556 aa  1014    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5270  urocanate hydratase  75.64 
 
 		 607 aa  868    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3441  urocanate hydratase  64.77 
 
 		 552 aa  740    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3404  urocanate hydratase  64.77 
 
 		 552 aa  740    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3353  urocanate hydratase  64.95 
 
 		 552 aa  741    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0647  urocanate hydratase  75.9 
 
 		 562 aa  880    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1334  urocanate hydratase  73.59 
 
 		 554 aa  853    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1330  urocanate hydratase  73.22 
 
 		 554 aa  852    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4828  urocanate hydratase  75.46 
 
 		 565 aa  867    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0896  urocanate hydratase  76.74 
 
 		 557 aa  882    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2715  urocanate hydratase  71.97 
 
 		 566 aa  843    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5636  urocanate hydratase  76.47 
 
 		 559 aa  876    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1100  urocanate hydratase  77.62 
 
 		 562 aa  895    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2794  urocanate hydratase  75.9 
 
 		 562 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0360  urocanate hydratase  76.1 
 
 		 560 aa  867    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2936  urocanase  68.82 
 
 		 908 aa  784    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5480  urocanate hydratase  77.44 
 
 		 562 aa  891    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1295  urocanate hydratase  75.77 
 
 		 554 aa  873    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0784383  normal  0.0497778 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3711  urocanate hydratase  64.77 
 
 		 552 aa  740    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0342728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1304  urocanate hydratase  74.95 
 
 		 556 aa  846    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.235615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1822  urocanate hydratase  76.98 
 
 		 562 aa  890    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1508  urocanate hydratase  63.17 
 
 		 546 aa  670    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1042  urocanate hydratase  68.39 
 
 		 579 aa  803    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0991609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1164  urocanate hydratase  67.99 
 
 		 572 aa  790    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2945  urocanate hydratase  75.45 
 
 		 562 aa  873    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0083  urocanate hydratase  88.09 
 
 		 564 aa  990    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1930  urocanate hydratase  68.82 
 
 		 572 aa  809    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2854  urocanate hydratase  72.28 
 
 		 568 aa  850    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5048  urocanate hydratase  74.63 
 
 		 559 aa  853    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1048  urocanate hydratase  63.9 
 
 		 557 aa  717    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.155699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2735  urocanate hydratase  62.13 
 
 		 565 aa  691    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29023  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3007  urocanate hydratase  73.22 
 
 		 562 aa  830    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.237465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1691  urocanate hydratase  75.68 
 
 		 553 aa  858    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5907  urocanate hydratase  77.44 
 
 		 562 aa  893    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0583  urocanate hydratase  61.36 
 
 		 554 aa  682    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1021  urocanate hydratase  76.95 
 
 		 566 aa  894    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5083  urocanate hydratase  77.02 
 
 		 557 aa  876    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0076  urocanate hydratase  74.82 
 
 		 563 aa  857    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2983  urocanate hydratase  74.46 
 
 		 562 aa  833    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.41142  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0099  urocanate hydratase  88.83 
 
 		 556 aa  1010    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0094  urocanate hydratase  89.01 
 
 		 556 aa  1011    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3953  urocanate hydratase  92.96 
 
 		 556 aa  1059    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1601  urocanate hydratase  75.96 
 
 		 555 aa  839    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.308587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2209  urocanate hydratase  77.26 
 
 		 562 aa  885    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67350  urocanate hydratase  75.92 
 
 		 559 aa  875    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2170  urocanate hydratase  77.44 
 
 		 562 aa  893    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.337819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2376  urocanate hydratase  59.02 
 
 		 570 aa  670    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0100  urocanate hydratase  88.83 
 
 		 556 aa  1008    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0715  urocanate hydratase  74.59 
 
 		 554 aa  837    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3338  urocanate hydratase  64.4 
 
 		 552 aa  733    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4397  urocanate hydratase  60.36 
 
 		 555 aa  660    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4169  urocanate hydratase  95.14 
 
 		 562 aa  1083    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1030  urocanate hydratase  81.95 
 
 		 559 aa  955    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.235061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2964  urocanate hydratase  68.93 
 
 		 574 aa  817    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0164648  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2364  urocanate hydratase  75.9 
 
 		 562 aa  880    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.738454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3646  urocanate hydratase  67.56 
 
 		 573 aa  787    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.455234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2921  urocanate hydratase  75.9 
 
 		 562 aa  880    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1580  urocanate hydratase  69 
 
 		 560 aa  783    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21091  normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4252  urocanate hydratase  90.27 
 
 		 555 aa  1031    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2665  urocanate hydratase  75.9 
 
 		 562 aa  880    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0150  urocanate hydratase  70.25 
 
 		 577 aa  827    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2721  urocanate hydratase  75.9 
 
 		 562 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1679  urocanate hydratase  75.9 
 
 		 562 aa  880    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3757  urocanate hydratase  94.23 
 
 		 556 aa  1080    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0181663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0102  urocanate hydratase  90.42 
 
 		 555 aa  1032    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1110  urocanate hydratase  59.67 
 
 		 549 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1263  urocanate hydratase  74.73 
 
 		 561 aa  860    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0079  urocanate hydratase  90.24 
 
 		 555 aa  1028    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4070  urocanate hydratase  75.92 
 
 		 553 aa  871    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0431  urocanate hydratase  77.02 
 
 		 557 aa  878    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0823  urocanate hydratase  80.76 
 
 		 565 aa  926    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000435883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1749  urocanate hydratase  74.82 
 
 		 556 aa  850    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.132868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6450  urocanate hydratase  70.86 
 
 		 556 aa  818    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2356  urocanate hydratase  62.41 
 
 		 553 aa  736    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0874  urocanate hydratase  73.6 
 
 		 557 aa  833    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4630  urocanate hydratase  74.5 
 
 		 555 aa  865    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4907  urocanate hydratase  76.65 
 
 		 557 aa  874    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.99976  normal  0.401042 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0852  urocanate hydratase  67.31 
 
 		 573 aa  798    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.371029  hitchhiker  0.00893346 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1893  urocanate hydratase  62.04 
 
 		 550 aa  729    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4656  urocanate hydratase  72.78 
 
 		 559 aa  826    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312199  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2399  urocanate hydratase  62.41 
 
 		 553 aa  736    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3902  urocanate hydratase  75.55 
 
 		 563 aa  867    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.736698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5833  urocanate hydratase  74.45 
 
 		 559 aa  859    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4452  urocanate hydratase  61.8 
 
 		 554 aa  656    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0891581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0097  urocanate hydratase  90.09 
 
 		 555 aa  1029    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1433  urocanate hydratase  73.78 
 
 		 557 aa  836    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2311  urocanate hydratase  64.4 
 
 		 552 aa  733    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.599874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2315  urocanate hydratase  61.69 
 
 		 546 aa  670    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641522  normal  0.0309572 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4086  urocanate hydratase  74.82 
 
 		 563 aa  857    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1461  urocanate hydratase  61.83 
 
 		 549 aa  692    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.801738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02073  urocanate hydratase  81.26 
 
 		 565 aa  934    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4447  urocanate hydratase  100 
 
 		 556 aa  1152    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0805  urocanate hydratase  75.55 
 
 		 593 aa  866    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>