49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4365 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  75.17 
 
 		 683 aa  933    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  74.83 
 
 		 683 aa  929    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  73.9 
 
 		 612 aa  955    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  100 
 
 		 615 aa  1268    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  74.83 
 
 		 683 aa  931    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  78.81 
 
 		 627 aa  993    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  74.66 
 
 		 663 aa  925    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  73.03 
 
 		 613 aa  926    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  74.66 
 
 		 684 aa  930    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  70.45 
 
 		 610 aa  872    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  75 
 
 		 659 aa  933    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  72.49 
 
 		 627 aa  929    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  75.13 
 
 		 658 aa  925    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  74.44 
 
 		 665 aa  919    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  65.64 
 
 		 619 aa  849    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  48.12 
 
 		 631 aa  571  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.09 
 
 		 609 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.66 
 
 		 634 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  39.34 
 
 		 634 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.45 
 
 		 581 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.16 
 
 		 581 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.09 
 
 		 581 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  33.21 
 
 		 592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.16 
 
 		 580 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  28.55 
 
 		 576 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.73 
 
 		 580 aa  253  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.84 
 
 		 577 aa  250  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  27.09 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  26.62 
 
 		 575 aa  207  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.68 
 
 		 526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  24.62 
 
 		 484 aa  140  8.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.13 
 
 		 618 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.35 
 
 		 599 aa  77.8  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.94 
 
 		 615 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  19.57 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  20.4 
 
 		 606 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.4 
 
 		 606 aa  71.6  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.29 
 
 		 506 aa  67  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  22.22 
 
 		 840 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.68 
 
 		 557 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.59 
 
 		 375 aa  48.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.73 
 
 		 829 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  26.92 
 
 		 823 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  24.88 
 
 		 871 aa  45.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  24.14 
 
 		 885 aa  45.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.64 
 
 		 834 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.44 
 
 		 553 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  23.23 
 
 		 858 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  22.52 
 
 		 816 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>