More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4204 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  65.32 
 
 
691 aa  952    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.66 
 
 
692 aa  1163    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  76.96 
 
 
686 aa  1135    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.84 
 
 
692 aa  1152    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  73.05 
 
 
680 aa  1022    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
688 aa  1424    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.97 
 
 
660 aa  284  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0410  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  29.23 
 
 
712 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0851483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  26.14 
 
 
654 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  25.71 
 
 
652 aa  229  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.67 
 
 
655 aa  227  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.45 
 
 
654 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  25.59 
 
 
655 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  25.59 
 
 
654 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.59 
 
 
654 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  26.1 
 
 
652 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.38 
 
 
910 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  25.37 
 
 
655 aa  212  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  24.1 
 
 
655 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.86 
 
 
708 aa  207  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.63 
 
 
667 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.75 
 
 
720 aa  183  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.11 
 
 
661 aa  181  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.94 
 
 
677 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  25.97 
 
 
656 aa  176  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  26.18 
 
 
656 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.49 
 
 
689 aa  170  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.78 
 
 
617 aa  169  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.17 
 
 
631 aa  169  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.5 
 
 
670 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.07 
 
 
682 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.68 
 
 
692 aa  164  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.28 
 
 
673 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.11 
 
 
642 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  25.77 
 
 
685 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.6 
 
 
686 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  25.23 
 
 
648 aa  160  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.76 
 
 
762 aa  158  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.69 
 
 
709 aa  157  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.6 
 
 
687 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.64 
 
 
688 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0490  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  25.07 
 
 
729 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  25.35 
 
 
693 aa  147  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.1 
 
 
697 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  23.92 
 
 
698 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  25.54 
 
 
691 aa  146  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1114  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.03 
 
 
701 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  25.19 
 
 
688 aa  145  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.2 
 
 
726 aa  144  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.85 
 
 
674 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00579  putative peptidase  26.24 
 
 
704 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1301  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.07 
 
 
678 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.32869  normal  0.0583688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5512  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.44 
 
 
634 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398053  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.69 
 
 
620 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0272535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.79 
 
 
681 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  22.53 
 
 
675 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.51 
 
 
698 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.64 
 
 
681 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.91 
 
 
695 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.95 
 
 
673 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2053  peptidase  35.12 
 
 
643 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.58101  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  34.72 
 
 
618 aa  130  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.59 
 
 
575 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  30.19 
 
 
674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.19 
 
 
674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.5 
 
 
667 aa  129  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.66 
 
 
673 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.04 
 
 
675 aa  128  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3040  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.16 
 
 
678 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.157189 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.51 
 
 
698 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  23.56 
 
 
648 aa  127  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.5 
 
 
681 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30410  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  32.35 
 
 
702 aa  127  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  30.58 
 
 
720 aa  127  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.61 
 
 
656 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0365  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.85 
 
 
664 aa  126  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  28.29 
 
 
678 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0810  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.19 
 
 
719 aa  124  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0412357  normal  0.0214856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.75 
 
 
665 aa  124  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1335  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.82 
 
 
643 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.62 
 
 
655 aa  123  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1094  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.09 
 
 
680 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.764126  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.94 
 
 
646 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1371  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.99 
 
 
644 aa  121  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1579  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.47 
 
 
642 aa  120  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.405414 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  29.93 
 
 
681 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.47 
 
 
668 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.98 
 
 
716 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.34 
 
 
666 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.533433  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  31.45 
 
 
646 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1344  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.66 
 
 
629 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.19 
 
 
693 aa  118  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.1 
 
 
672 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  29.09 
 
 
632 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.9 
 
 
596 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0904  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.99 
 
 
664 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.496036  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0184  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.93 
 
 
698 aa  116  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  28.16 
 
 
648 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  23.3 
 
 
684 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.77 
 
 
652 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>