69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4179 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  100 
 
 
120 aa  251  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  76.72 
 
 
116 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  55.17 
 
 
117 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  51.72 
 
 
117 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  53.45 
 
 
117 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  50.86 
 
 
117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  50.86 
 
 
117 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  50 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  51.72 
 
 
117 aa  120  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  51.75 
 
 
117 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  51.52 
 
 
101 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  38.4 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  40 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  36.8 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  40.8 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  40.43 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  42.06 
 
 
126 aa  77  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  37.39 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  41.44 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  37.93 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  37.93 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  34 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  32.76 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  34 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  32.04 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  37.61 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  34 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  38.96 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  38.96 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  32.26 
 
 
596 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  32.23 
 
 
596 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  33.87 
 
 
596 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  33.33 
 
 
583 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  31.45 
 
 
596 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.87 
 
 
593 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  34.45 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  31.3 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  37.66 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  34.12 
 
 
589 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  35.23 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  30 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  26.55 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.82 
 
 
591 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.05 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.91 
 
 
596 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  32.67 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  29.91 
 
 
596 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  29.91 
 
 
596 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  35.06 
 
 
155 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  37.8 
 
 
596 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0627  hypothetical protein  34.75 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.593343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  31.17 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  29.06 
 
 
597 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  29.06 
 
 
596 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  29.31 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  31.75 
 
 
589 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  31.36 
 
 
596 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  31.36 
 
 
596 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  31.36 
 
 
596 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  31.36 
 
 
596 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  33.33 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  43.55 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  37.35 
 
 
598 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1393  hypothetical protein  38.6 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  30.68 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  32.56 
 
 
150 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  34.94 
 
 
598 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  30.28 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.91 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>