More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4108 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_4108  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  100 
 
 
305 aa  624  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000620786  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0515  Ppx/GppA phosphatase  81.31 
 
 
311 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0400  Ppx/GppA phosphatase  80 
 
 
303 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0340  Ppx/GppA phosphatase  73.09 
 
 
310 aa  454  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00977932  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3950  Ppx/GppA phosphatase  71.76 
 
 
308 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3431  Ppx/GppA phosphatase  71.76 
 
 
308 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3927  Ppx/GppA phosphatase  71.1 
 
 
308 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3875  Ppx/GppA phosphatase  71.1 
 
 
308 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0412  Ppx/GppA phosphatase  71.43 
 
 
308 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3613  Ppx/GppA phosphatase  71.43 
 
 
308 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0411  Ppx/GppA phosphatase  71.76 
 
 
308 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4068  Ppx/GppA phosphatase  71.1 
 
 
308 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0408  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  71.76 
 
 
306 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0450  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  64.9 
 
 
310 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3214  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  68.21 
 
 
305 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0213985  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0462  Ppx/GppA phosphatase  62.83 
 
 
313 aa  381  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00339  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.22 
 
 
497 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2696  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.89 
 
 
497 aa  248  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4006  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  45.02 
 
 
495 aa  242  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00565502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.44 
 
 
493 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.44 
 
 
493 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.44 
 
 
493 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.44 
 
 
493 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.44 
 
 
493 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.43 
 
 
498 aa  237  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  43.92 
 
 
494 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.05 
 
 
498 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  43.92 
 
 
494 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  43.92 
 
 
494 aa  236  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.92 
 
 
494 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.92 
 
 
494 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.92 
 
 
494 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.92 
 
 
494 aa  236  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.92 
 
 
494 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.92 
 
 
494 aa  236  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.43 
 
 
498 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4037  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.76 
 
 
498 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.868911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0508  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.76 
 
 
498 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.577686  normal  0.0821648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0177  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  42.76 
 
 
498 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  44.26 
 
 
498 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  43.92 
 
 
500 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  40.39 
 
 
519 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  40.39 
 
 
519 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  40.39 
 
 
519 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  40 
 
 
526 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  40 
 
 
526 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  40 
 
 
526 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  40 
 
 
526 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  40.14 
 
 
516 aa  223  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  40 
 
 
513 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  39.67 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  39.67 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  39.67 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  39.67 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  39.67 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  39.67 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  39.67 
 
 
513 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  39.33 
 
 
513 aa  221  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  39.67 
 
 
511 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  39.33 
 
 
513 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  40 
 
 
509 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  39.33 
 
 
511 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  40.97 
 
 
500 aa  219  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2673  exopolyphosphatase  40.33 
 
 
509 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  39.22 
 
 
516 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  39.33 
 
 
513 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00567  guanosine pentaphosphatase  41.92 
 
 
503 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  41.97 
 
 
506 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  41.39 
 
 
501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  40.73 
 
 
501 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  41.97 
 
 
501 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  39.27 
 
 
501 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  40.33 
 
 
500 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  40.8 
 
 
526 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  39.67 
 
 
520 aa  209  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  40.07 
 
 
505 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4220  Ppx/GppA phosphatase  41.41 
 
 
503 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.532026  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  38.44 
 
 
506 aa  206  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  39.34 
 
 
500 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0943  Ppx/GppA phosphatase  40.4 
 
 
499 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460574  normal  0.102759 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  38.57 
 
 
502 aa  202  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  38.8 
 
 
506 aa  202  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  38.69 
 
 
500 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  35.5 
 
 
509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  38.69 
 
 
500 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  38.41 
 
 
501 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  40.13 
 
 
500 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  38.69 
 
 
500 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  36.79 
 
 
500 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002095  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate pyrophosphatase  42 
 
 
439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.412394  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  37.83 
 
 
508 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  39.8 
 
 
499 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  37.29 
 
 
501 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3192  Ppx/GppA phosphatase  40.34 
 
 
308 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1820  Ppx/GppA phosphatase  37.63 
 
 
520 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2456  Ppx/GppA phosphatase  37.63 
 
 
520 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00465936  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  38.69 
 
 
500 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1869  Ppx/GppA phosphatase  37.63 
 
 
520 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.164505  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1833  Ppx/GppA phosphatase  37.63 
 
 
520 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1441  exopolyphosphatase  37 
 
 
503 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>