More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4098 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.01 
 
 		 546 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  58.01 
 
 		 546 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.01 
 
 		 546 aa  652    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  78.87 
 
 		 549 aa  930    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  91.07 
 
 		 549 aa  1061    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0250  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  56.75 
 
 		 543 aa  648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4201  ubiquinone biosynthesis protein AarF  79.6 
 
 		 549 aa  930    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3761  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.64 
 
 		 545 aa  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  100 
 
 		 549 aa  1140    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4054  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.01 
 
 		 546 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4245  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.46 
 
 		 546 aa  647    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806176  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.01 
 
 		 546 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0504  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  79.96 
 
 		 549 aa  938    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  58.01 
 
 		 546 aa  652    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  59.19 
 
 		 546 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  85.4 
 
 		 549 aa  997    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.64 
 
 		 545 aa  655    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0273  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.96 
 
 		 543 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  56.91 
 
 		 544 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.17 
 
 		 546 aa  643    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0459  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  75.77 
 
 		 549 aa  885    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.01 
 
 		 546 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  78.87 
 
 		 549 aa  930    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.01 
 
 		 546 aa  652    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  59.19 
 
 		 546 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4218  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  57.54 
 
 		 546 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  86.16 
 
 		 549 aa  1007    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  78.69 
 
 		 549 aa  928    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.01 
 
 		 546 aa  652    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3943  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.96 
 
 		 543 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3553  2-octaprenylphenol hydroxylase  79.23 
 
 		 549 aa  933    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.96851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0403  2-octaprenylphenol hydroxylase  79.42 
 
 		 549 aa  934    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.977603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0473  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  78.87 
 
 		 549 aa  922    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  78.69 
 
 		 549 aa  928    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3639  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.96 
 
 		 543 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  59.19 
 
 		 546 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  59.19 
 
 		 546 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3727  2-octaprenylphenol hydroxylase  80.15 
 
 		 549 aa  941    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  59.19 
 
 		 546 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  78.14 
 
 		 549 aa  916    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  55.9 
 
 		 544 aa  634  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  56.09 
 
 		 544 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.91 
 
 		 546 aa  627  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  54.06 
 
 		 543 aa  622  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4211  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.55 
 
 		 544 aa  620  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  56.46 
 
 		 529 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0296  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  58.28 
 
 		 522 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877142  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0544  2-octaprenylphenol hydroxylase  53.78 
 
 		 544 aa  588  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.71 
 
 		 558 aa  551  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.54 
 
 		 547 aa  529  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.61 
 
 		 547 aa  528  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.52 
 
 		 533 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  48.52 
 
 		 533 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.36 
 
 		 561 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  49.22 
 
 		 553 aa  505  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  55.79 
 
 		 549 aa  503  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  55.32 
 
 		 549 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.79 
 
 		 540 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.58 
 
 		 537 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5152  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  50.63 
 
 		 539 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.05 
 
 		 539 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  48.89 
 
 		 525 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52 
 
 		 540 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  49.41 
 
 		 509 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  52.11 
 
 		 527 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  51.27 
 
 		 542 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0452  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.11 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.755983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  48.39 
 
 		 525 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1186  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.44 
 
 		 556 aa  479  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.67 
 
 		 534 aa  478  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  46.67 
 
 		 525 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  51.16 
 
 		 506 aa  477  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  48.25 
 
 		 525 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  51.48 
 
 		 534 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0652  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  47.33 
 
 		 525 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.559631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4047  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  47.85 
 
 		 525 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  51.99 
 
 		 540 aa  477  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  48.25 
 
 		 525 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.88 
 
 		 553 aa  476  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  45.92 
 
 		 525 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  46.11 
 
 		 525 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  47.3 
 
 		 514 aa  473  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  47.24 
 
 		 527 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  46.11 
 
 		 525 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  46.11 
 
 		 525 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  47.7 
 
 		 522 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.5 
 
 		 557 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  45.54 
 
 		 525 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  45.73 
 
 		 525 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  45.73 
 
 		 525 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0189  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  46.99 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0686  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  46.99 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2401  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  46.99 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  46.99 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  46.99 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  47.13 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0670  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  46.99 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.49 
 
 		 522 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  46.63 
 
 		 521 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  46.99 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>