More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4081 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  40.35 
 
 		 1070 aa  736    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2579  heavy metal efflux pump CzcA  36.33 
 
 		 1081 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.820402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  39.29 
 
 		 1034 aa  737    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  36.2 
 
 		 1446 aa  681    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  38.22 
 
 		 1034 aa  705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  37.23 
 
 		 1053 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  38.16 
 
 		 1048 aa  684    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  40.77 
 
 		 1077 aa  730    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  38.53 
 
 		 1045 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  38.99 
 
 		 1021 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  39.14 
 
 		 1032 aa  699    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  39.05 
 
 		 1033 aa  731    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0225  CzcA family heavy metal efflux protein  39.67 
 
 		 1040 aa  692    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  36.24 
 
 		 1459 aa  668    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0614  CzcA family heavy metal efflux protein  38.81 
 
 		 1069 aa  666    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  38.53 
 
 		 1049 aa  658    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2319  CzcA family heavy metal efflux protein  42.18 
 
 		 1035 aa  716    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  40.09 
 
 		 1040 aa  714    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  38.89 
 
 		 1064 aa  703    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  37.66 
 
 		 1038 aa  654    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  64.52 
 
 		 1066 aa  1371    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  38.78 
 
 		 1062 aa  676    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  84.31 
 
 		 1075 aa  1797    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  38.01 
 
 		 1053 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  40.77 
 
 		 1077 aa  726    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4384  CzcA family heavy metal efflux protein  37.29 
 
 		 1047 aa  670    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.55849  normal  0.35087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  38.96 
 
 		 1061 aa  677    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  38.21 
 
 		 1049 aa  701    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  38.16 
 
 		 1052 aa  690    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  40.77 
 
 		 1077 aa  730    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  38.22 
 
 		 1054 aa  703    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  38.85 
 
 		 1036 aa  657    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  38.13 
 
 		 1033 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  38.16 
 
 		 1048 aa  683    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  41.74 
 
 		 1032 aa  778    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  85.71 
 
 		 1068 aa  1800    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  80.73 
 
 		 1062 aa  1711    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  41.34 
 
 		 1032 aa  770    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  40.35 
 
 		 1070 aa  736    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4154  CzcA family heavy metal efflux protein  39.03 
 
 		 1046 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  38.57 
 
 		 1038 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  38.01 
 
 		 1075 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5655  heavy metal efflux pump CzcA  37.55 
 
 		 1037 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  38.77 
 
 		 1051 aa  692    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  38.34 
 
 		 1059 aa  714    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  37.4 
 
 		 1066 aa  638    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  40.77 
 
 		 1077 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  40.25 
 
 		 1045 aa  712    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  39.34 
 
 		 1047 aa  693    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  37.79 
 
 		 1062 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  40.87 
 
 		 1077 aa  728    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  38.25 
 
 		 1050 aa  707    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  37.9 
 
 		 1054 aa  699    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  40.26 
 
 		 1070 aa  736    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4301  CzcA family heavy metal efflux protein  35.29 
 
 		 1017 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  39.3 
 
 		 1034 aa  729    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.68 
 
 		 1481 aa  639    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  64.25 
 
 		 1065 aa  1383    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  61.53 
 
 		 1064 aa  1345    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  38.21 
 
 		 1037 aa  676    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3369  CzcA family heavy metal efflux protein  38.31 
 
 		 1060 aa  664    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  38.71 
 
 		 1040 aa  711    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  40.87 
 
 		 1077 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  38.12 
 
 		 1019 aa  709    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  38.29 
 
 		 1058 aa  666    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  40.68 
 
 		 1077 aa  721    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  42.49 
 
 		 1022 aa  729    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  37.51 
 
 		 1037 aa  647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  85.39 
 
 		 1076 aa  1840    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  38.55 
 
 		 1032 aa  741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  37.23 
 
 		 1053 aa  694    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  85.49 
 
 		 1070 aa  1817    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  40.06 
 
 		 1043 aa  705    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  38.83 
 
 		 1038 aa  701    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  42.16 
 
 		 1046 aa  778    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  38.55 
 
 		 1031 aa  748    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  38.05 
 
 		 1455 aa  732    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  37.82 
 
 		 1040 aa  678    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  39.17 
 
 		 1046 aa  693    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  40.57 
 
 		 1083 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  82.21 
 
 		 1077 aa  1734    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  37.76 
 
 		 1070 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  37.82 
 
 		 1070 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  38.13 
 
 		 1056 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3995  CzcA family heavy metal efflux protein  36.97 
 
 		 1047 aa  665    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  85.34 
 
 		 1075 aa  1799    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  37.76 
 
 		 1069 aa  679    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  37.88 
 
 		 1072 aa  666    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  85.49 
 
 		 1070 aa  1817    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  39.23 
 
 		 1048 aa  687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  38.41 
 
 		 1063 aa  697    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7181  heavy metal efflux pump CzcA  38.86 
 
 		 1062 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  85.3 
 
 		 1070 aa  1815    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  80.92 
 
 		 1066 aa  1717    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  39 
 
 		 1023 aa  697    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  38.8 
 
 		 1043 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0099  CzcA family heavy metal efflux protein  35.29 
 
 		 1017 aa  636    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  38.87 
 
 		 1456 aa  717    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
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NC_009485  BBta_7263  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  37.98 
 
 		 1060 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.24626 
 
 
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NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  85.71 
 
 		 1068 aa  1803    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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