More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4053 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  74.4 
 
 		 479 aa  781    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  74.3 
 
 		 479 aa  780    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  75.2 
 
 		 479 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  76.41 
 
 		 499 aa  823    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  79.72 
 
 		 493 aa  850    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  74.19 
 
 		 479 aa  782    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  74.5 
 
 		 479 aa  777    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  75 
 
 		 479 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  100 
 
 		 498 aa  1046    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  78.09 
 
 		 494 aa  819    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  74.4 
 
 		 479 aa  781    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  76.86 
 
 		 485 aa  816    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  74.6 
 
 		 479 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  75.15 
 
 		 500 aa  802    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  74.3 
 
 		 479 aa  780    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  77.23 
 
 		 503 aa  797    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  74.8 
 
 		 479 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  74.3 
 
 		 479 aa  779    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  74.55 
 
 		 482 aa  779    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  76.04 
 
 		 505 aa  820    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  74.3 
 
 		 479 aa  780    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  74.3 
 
 		 479 aa  780    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  77.76 
 
 		 504 aa  842    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  74.6 
 
 		 479 aa  789    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  59.24 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  57.97 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  53.81 
 
 		 396 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  52.28 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  53.15 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  50.51 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  49.75 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  50.25 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  47.61 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  42.57 
 
 		 399 aa  352  8e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  40.94 
 
 		 404 aa  320  3e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.13 
 
 		 397 aa  315  9e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  40.1 
 
 		 404 aa  309  9e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  40.94 
 
 		 407 aa  307  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 		 405 aa  307  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  38.85 
 
 		 404 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  39.55 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  38.35 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  39.22 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  38.19 
 
 		 404 aa  292  9e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  39.24 
 
 		 403 aa  290  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  39.04 
 
 		 392 aa  289  9e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  38.13 
 
 		 387 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  39.35 
 
 		 387 aa  286  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  41.58 
 
 		 387 aa  286  8e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  38.99 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1153  beta-lactamase domain-containing protein  38.96 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  36.15 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  40.15 
 
 		 418 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  38.38 
 
 		 387 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.53 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0456  beta-lactamase domain-containing protein  38.42 
 
 		 407 aa  276  6e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.71 
 
 		 396 aa  276  8e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  37.19 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 391 aa  272  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.6 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  37.72 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1554  beta-lactamase-like  37.97 
 
 		 410 aa  269  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0457538  normal  0.358726 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0457  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.02 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  37.28 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  37.22 
 
 		 400 aa  261  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  36.78 
 
 		 402 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0955  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 409 aa  252  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.86403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 		 397 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  34.74 
 
 		 884 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  37.54 
 
 		 399 aa  243  5e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  35.16 
 
 		 878 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  35.16 
 
 		 878 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  33.83 
 
 		 508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  35.47 
 
 		 423 aa  230  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  32.66 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  32.66 
 
 		 399 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  33.25 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  31.81 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  31.73 
 
 		 396 aa  215  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  33.42 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0481  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 576 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  31.25 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  33.25 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2508  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 		 571 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00548626  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0770  flavin reductase-like, FMN-binding  29.72 
 
 		 574 aa  203  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  31.92 
 
 		 407 aa  203  7e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 		 395 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  32.49 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3606  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 		 571 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1162  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  29.82 
 
 		 569 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  34.71 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  34.71 
 
 		 406 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1803  flavin reductase-like, FMN-binding  29.98 
 
 		 570 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  32.01 
 
 		 407 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 425 aa  199  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>