33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3977 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  288  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  83.21 
 
 		 137 aa  246  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  60 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  47.24 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  43.86 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  42.73 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  44.44 
 
 		 157 aa  96.7  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  40.98 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  35.25 
 
 		 135 aa  92.8  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0950  hypothetical protein  40.24 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000580743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  30.51 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  33.02 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.23 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  31.68 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  32.04 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  28.69 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  28.69 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  28.69 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  28.69 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  26.77 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  25.95 
 
 		 142 aa  48.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  29.46 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  25.27 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  25.41 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  31.37 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  24.81 
 
 		 138 aa  43.5  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  27.05 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  29.13 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  25.58 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  26.4 
 
 		 136 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  26.05 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  24.39 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  27.35 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>