More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3951 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  100 
 
 
188 aa  390  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  34.29 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  35.57 
 
 
422 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.5 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  34.07 
 
 
437 aa  108  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.21 
 
 
446 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.77 
 
 
169 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  35.92 
 
 
161 aa  104  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  35.51 
 
 
170 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  31.85 
 
 
433 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  33.58 
 
 
184 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  35.61 
 
 
168 aa  101  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.88 
 
 
447 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.88 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  38.64 
 
 
187 aa  98.2  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.29 
 
 
183 aa  98.2  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  32.28 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  32.85 
 
 
171 aa  96.3  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.24 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  32.32 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  36.97 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  35.38 
 
 
195 aa  95.5  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2908  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  35.1 
 
 
199 aa  95.1  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629655  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.33 
 
 
184 aa  94.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.82 
 
 
184 aa  94.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  32.75 
 
 
165 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.55 
 
 
223 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  36.13 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  36.13 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  36.13 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  36.13 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  36.13 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  31.75 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  36.13 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  38.1 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  31.34 
 
 
194 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  32.48 
 
 
189 aa  92.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2085  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.4 
 
 
173 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  33.85 
 
 
179 aa  92  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1860  cytochrome c biogenesis protein, thiol-disulfide interchange protein  37.59 
 
 
173 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.56 
 
 
187 aa  91.3  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  32.86 
 
 
165 aa  91.3  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2000  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.21 
 
 
173 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  30.67 
 
 
205 aa  91.3  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  29.85 
 
 
173 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.68 
 
 
191 aa  91.3  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.39 
 
 
184 aa  90.9  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  30.6 
 
 
194 aa  91.3  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  26.74 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  31.43 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  32.2 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  29.1 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.86 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  31.29 
 
 
248 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  38.84 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  36.97 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  33.61 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  33.61 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.23 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  36.97 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  30.08 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  31.2 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  33.61 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  33.61 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  33.61 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  30.29 
 
 
172 aa  90.1  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  31.2 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  33.61 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  32.96 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  31.2 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  33.61 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  32.88 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  29.93 
 
 
176 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.11 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  34.23 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
179 aa  89  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  31.2 
 
 
173 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.79 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  26.32 
 
 
194 aa  87.8  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2803  putative thioredoxin  32.77 
 
 
172 aa  87.8  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  30.47 
 
 
170 aa  87.8  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  31.41 
 
 
193 aa  87.8  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.88 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  29.1 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  28.36 
 
 
173 aa  87  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  35.77 
 
 
178 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  34.78 
 
 
186 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.14 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  33.61 
 
 
191 aa  87  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  35.06 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32 
 
 
280 aa  87.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  29.24 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  30.2 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  34.48 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  32.79 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2801  thiol-disulfide interchange protein  34.75 
 
 
153 aa  85.9  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00941693  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30.36 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  35.4 
 
 
167 aa  85.9  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.56 
 
 
206 aa  85.9  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>