27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3874 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  233  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  73.21 
 
 		 109 aa  166  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0623  hypothetical protein  57.66 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0616  hypothetical protein  56.76 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414361  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0651  hypothetical protein  56.76 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000188562  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3413  hypothetical protein  56.76 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000138823  normal  0.329766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0617  hypothetical protein  56.76 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000242002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0577  hypothetical protein  55.86 
 
 		 115 aa  129  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00197884  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3874  hypothetical protein  55.86 
 
 		 115 aa  129  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000309341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3748  hypothetical protein  55.86 
 
 		 115 aa  129  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0891426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3691  hypothetical protein  55.86 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3005  hypothetical protein  49.11 
 
 		 114 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000355724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0584  hypothetical protein  54.44 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00300104  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  57.14 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3293  hypothetical protein  40.71 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34.78 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.38 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  28.99 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  32.39 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  26.88 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  29.67 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  29.67 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.53 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  24.1 
 
 		 104 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  28.57 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  25 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  25.76 
 
 		 127 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>