162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3865 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3865  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 323 aa  670    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  72.98 
 
 		 323 aa  510  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  71.7 
 
 		 347 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  71.7 
 
 		 347 aa  477  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  71.38 
 
 		 347 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  71.38 
 
 		 347 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  68.73 
 
 		 326 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  68.87 
 
 		 342 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  69.5 
 
 		 327 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  69.81 
 
 		 327 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  69.81 
 
 		 327 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  67.61 
 
 		 327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  66.67 
 
 		 325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  65.31 
 
 		 327 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  64.15 
 
 		 323 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  63.04 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  45.96 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  45.17 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  45.2 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5167  alpha/beta hydrolase fold  44.75 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  42.01 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  44.44 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4990  alpha/beta hydrolase fold  44.58 
 
 		 330 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1594  hypothetical protein  44.75 
 
 		 327 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  42.41 
 
 		 321 aa  268  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  44.55 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0348  alpha/beta hydrolase fold  45.79 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  44.24 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 		 353 aa  265  8e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  46.84 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  44.69 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  44.69 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  44.69 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  43.34 
 
 		 344 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  44.51 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03500  hydrolase, alpha/beta fold family  43.93 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4029  putative hydrolase  42.24 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  42.77 
 
 		 340 aa  255  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  43.51 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  43.51 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  43.51 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  42.77 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  42.77 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  42.45 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  44.04 
 
 		 337 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  42.45 
 
 		 340 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  42.45 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002282  alpha/beta fold family hydrolase  42.58 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.495797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  43.23 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0373  putative hydrolase  42.19 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2188  putative hydrolase  42.39 
 
 		 329 aa  242  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  42.14 
 
 		 340 aa  242  7.999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5341  Alpha/beta hydrolase fold  43.73 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  38.99 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3849  putative hydrolase  41.46 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3697  putative hydrolase  43.96 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3940  putative hydrolase  43.96 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.779857  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0256  putative hydrolase  43.96 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2510  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4576  putative hydrolase  42.28 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0617154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  40.25 
 
 		 342 aa  229  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  43.79 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1905  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.69 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  41.12 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0297  putative hydrolase  41.88 
 
 		 331 aa  222  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  38.81 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  37.42 
 
 		 332 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.28 
 
 		 318 aa  208  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  39.06 
 
 		 356 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  40.07 
 
 		 371 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  37.98 
 
 		 372 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  38.2 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  38.01 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  39.07 
 
 		 358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 		 345 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 		 345 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  35.86 
 
 		 384 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  38.01 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  38.01 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  38.01 
 
 		 345 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0488  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  39.05 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1863  hypothetical protein  34.26 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000338948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 		 346 aa  192  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1427  Alpha/beta hydrolase fold-1  35.96 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  38.27 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0670  hypothetical protein  37.82 
 
 		 324 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0404609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  37.85 
 
 		 344 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  36.92 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  36.92 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  36.92 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  36.92 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  36.92 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  36.92 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  36.92 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  37.01 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  37.86 
 
 		 326 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>