130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3842 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  73 
 
 
500 aa  743  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  1.93925e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  100 
 
 
500 aa  1013  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  5.03049e-08 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  60 
 
 
495 aa  598  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  59 
 
 
495 aa  596  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  51.38 
 
 
508 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  51.38 
 
 
508 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  51.38 
 
 
508 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  51.18 
 
 
498 aa  507  1e-142  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  52.06 
 
 
503 aa  502  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  51.67 
 
 
503 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  51.67 
 
 
503 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  51.47 
 
 
503 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  50.88 
 
 
508 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  50.1 
 
 
494 aa  466  1e-130  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  44.22 
 
 
492 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  33.46 
 
 
510 aa  253  4e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  34.29 
 
 
505 aa  241  3e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  31.98 
 
 
529 aa  226  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  30.62 
 
 
505 aa  214  3e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  41.84 
 
 
321 aa  212  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  31.49 
 
 
502 aa  209  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  29.64 
 
 
501 aa  189  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  33.85 
 
 
433 aa  170  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  34.46 
 
 
433 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  37.8 
 
 
435 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  34.15 
 
 
433 aa  166  1e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.01225e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  34.15 
 
 
433 aa  166  1e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  4.45512e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  34.15 
 
 
433 aa  166  1e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  34.15 
 
 
433 aa  166  1e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  34.15 
 
 
433 aa  166  1e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  37.07 
 
 
433 aa  165  2e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  36.82 
 
 
445 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  37.07 
 
 
433 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  37.07 
 
 
433 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  36.68 
 
 
433 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  37.07 
 
 
433 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  35.4 
 
 
433 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  33.85 
 
 
433 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  39.53 
 
 
435 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  39.53 
 
 
435 aa  161  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  39.53 
 
 
435 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.34146e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  39.77 
 
 
495 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  34.66 
 
 
443 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  33.68 
 
 
433 aa  146  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  35.06 
 
 
443 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  28.71 
 
 
535 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0798  adenylate cyclase  35.06 
 
 
443 aa  132  2e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  39.82 
 
 
347 aa  123  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  35.44 
 
 
213 aa  115  1e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  35.44 
 
 
213 aa  115  1e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  35.44 
 
 
213 aa  115  1e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  35.44 
 
 
213 aa  115  1e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  35.44 
 
 
213 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  31.16 
 
 
512 aa  113  1e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  35.75 
 
 
215 aa  112  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  35.75 
 
 
215 aa  112  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  30.82 
 
 
512 aa  110  4e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  35.68 
 
 
208 aa  110  7e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  35.68 
 
 
208 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  35.68 
 
 
208 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  34.45 
 
 
315 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  31.91 
 
 
512 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  32.16 
 
 
519 aa  107  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  28.72 
 
 
494 aa  106  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  34.39 
 
 
286 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  38.82 
 
 
211 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  34.47 
 
 
213 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  33.08 
 
 
511 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  32.41 
 
 
510 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  35.21 
 
 
208 aa  101  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  32.16 
 
 
487 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  31.4 
 
 
505 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0435  adenylate cyclase  34.93 
 
 
208 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0459  adenylate cyclase  34.93 
 
 
208 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.211373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  32.86 
 
 
208 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  34.62 
 
 
499 aa  94  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  33.64 
 
 
219 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  36.45 
 
 
291 aa  92.8  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  32.86 
 
 
490 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  29.68 
 
 
543 aa  91.3  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  33.08 
 
 
540 aa  90.5  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  32.26 
 
 
219 aa  90.1  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  33.17 
 
 
208 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  33.94 
 
 
511 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  30.3 
 
 
508 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  26.11 
 
 
596 aa  85.5  2e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2864  adenylate cyclase  35.59 
 
 
208 aa  85.9  2e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39702  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  33.33 
 
 
207 aa  84.7  4e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  29.01 
 
 
513 aa  84  5e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  34.87 
 
 
321 aa  84  6e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  31.28 
 
 
514 aa  83.6  8e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  38.24 
 
 
454 aa  82.8  1e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3027  adenylate cyclase  34.45 
 
 
206 aa  81.6  3e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0441666  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  31.22 
 
 
505 aa  80.9  5e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  33.33 
 
 
508 aa  80.5  6e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  32.37 
 
 
489 aa  80.1  9e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  32.37 
 
 
489 aa  80.1  9e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  27.37 
 
 
510 aa  79.7  1e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  29.46 
 
 
508 aa  77.8  4e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2886  hypothetical protein  34.65 
 
 
223 aa  78.2  4e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.521517 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>