135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3829 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3829  putative ABC transport system permease protein  100 
 
 		 263 aa  507  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000396404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0731  hypothetical protein  76.83 
 
 		 271 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003828  ABC-type uncharacterized transport system permease component  59.92 
 
 		 270 aa  318  7e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2942  hypothetical protein  61.33 
 
 		 256 aa  315  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01854  hypothetical protein  58.17 
 
 		 266 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0630  hypothetical protein  60.23 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0826  membrane protein  58.27 
 
 		 263 aa  277  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  41.57 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1145  ABC transporter, inner membrane subunit  39.15 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000431161  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0214  hypothetical protein  37.64 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.458812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1858  putative ABC transport system permease protein  35.69 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0986378  normal  0.82732 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  38.01 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  43 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  35.81 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3073  hypothetical protein  39.85 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  33.2 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  38.89 
 
 		 261 aa  135  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  37.6 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  35.16 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  39.6 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0080  ABC transporter permease  32.16 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  35.53 
 
 		 263 aa  131  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  33.64 
 
 		 265 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  33.48 
 
 		 267 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  34.82 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  35.43 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  33.88 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  32.67 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  36.32 
 
 		 251 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000359378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  34.33 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  32.88 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  32.88 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  32.88 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  32.94 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  32.42 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  32.42 
 
 		 265 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  34.8 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  33.91 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  37.45 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  31.62 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  33.04 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  31.56 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  32.03 
 
 		 262 aa  119  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000207096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  32.03 
 
 		 262 aa  119  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000302353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  40.32 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  35.29 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1097  hypothetical protein  32.26 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  36.24 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  32.48 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  32.06 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2239  hypothetical protein  34.76 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255232  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  32.17 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7995  hypothetical protein  34.76 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138428  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  34.5 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  33.74 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2410  hypothetical protein  34.74 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0072  hypothetical protein  34.33 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  31.69 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  32.51 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  32.51 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  32.51 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  32.51 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  32.79 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  35.64 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  28.87 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  31.28 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  32.02 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  32.02 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  32.02 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  32.2 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  32.2 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2037  hypothetical protein  30.7 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.179883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  33.51 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  31.12 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2104  hypothetical protein  36.14 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2290  hypothetical protein  35.78 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000247425 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3122  hypothetical protein  33 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.859294  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  33.04 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  31.69 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  31.69 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  31.69 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  34.33 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  31.69 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  31.69 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  31.69 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  31.69 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  31.69 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  34.86 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  31.98 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  31.98 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  31.98 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  31.98 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  31.98 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  31.98 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  31.98 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  31.69 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>