More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3824 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3824  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 469 aa  961    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000529085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0759  peptidase M16 domain-containing protein  69.23 
 
 		 483 aa  648    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3445  peptidase M16 domain-containing protein  61.65 
 
 		 490 aa  596  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0655  peptidase M16 domain-containing protein  59.29 
 
 		 474 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3093  peptidase M16 domain-containing protein  58.64 
 
 		 471 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0599464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0879  peptidase M16 domain-containing protein  58.69 
 
 		 471 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0630981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0842  peptidase M16 domain-containing protein  58.24 
 
 		 471 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.060004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3429  peptidase M16 domain-containing protein  54.89 
 
 		 472 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0907  peptidase M16 domain-containing protein  53.83 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0932  peptidase M16 domain protein  55.11 
 
 		 472 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0941  peptidase M16 domain-containing protein  55.56 
 
 		 472 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0724  Zn-dependent peptidase-like protein  46.71 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  35.41 
 
 		 447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  31.53 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  32.13 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  32.37 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  34.01 
 
 		 945 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  32.66 
 
 		 974 aa  160  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  34.27 
 
 		 944 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0081  peptidase M16 domain-containing protein  33.45 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  31.81 
 
 		 949 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  31.81 
 
 		 949 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  31.81 
 
 		 949 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  32.02 
 
 		 944 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0863  peptidase M16 domain protein  30.6 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  31.81 
 
 		 944 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  33.05 
 
 		 944 aa  156  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4128  peptidase M16 domain-containing protein  32.21 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  31.52 
 
 		 949 aa  156  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  31.27 
 
 		 945 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  32.02 
 
 		 943 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  31.74 
 
 		 950 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  31.74 
 
 		 944 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  31.74 
 
 		 950 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  26.89 
 
 		 440 aa  152  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  31.74 
 
 		 950 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  30.82 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3747  peptidase M16 domain-containing protein  30.81 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  28.54 
 
 		 954 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  28.37 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  31.14 
 
 		 429 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  27.41 
 
 		 440 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  31.14 
 
 		 429 aa  143  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0931  peptidase M16 domain-containing protein  30.71 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  28.85 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  29.16 
 
 		 947 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  29.25 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  26.88 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  27.03 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  29.23 
 
 		 958 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  32.17 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  30.51 
 
 		 947 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  26.8 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  27.8 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  24.18 
 
 		 929 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  25.74 
 
 		 526 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  31.34 
 
 		 954 aa  136  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  32.17 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  26.62 
 
 		 950 aa  136  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  32.17 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1582  peptidase M16 domain protein  31.71 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157753  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  32.17 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  31.12 
 
 		 952 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  34.17 
 
 		 904 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06870  predicted Zn-dependent peptidase  28.47 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.677092  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  29.25 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  25.53 
 
 		 520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  34.17 
 
 		 901 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1775  peptidase M16 domain-containing protein  29.57 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  33.45 
 
 		 903 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  25.18 
 
 		 489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  25.74 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  27.63 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  26.02 
 
 		 469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  25.78 
 
 		 461 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  40.74 
 
 		 423 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  25.19 
 
 		 415 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  28.33 
 
 		 945 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  27.67 
 
 		 411 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  35.32 
 
 		 952 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  26.5 
 
 		 919 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  26.14 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  30.99 
 
 		 959 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  27.25 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  25.5 
 
 		 928 aa  127  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6664  peptidase M16 domain protein  26.35 
 
 		 452 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  37.75 
 
 		 959 aa  126  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  30.61 
 
 		 969 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  27.82 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  26.26 
 
 		 528 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  27.89 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  24.7 
 
 		 476 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  29.62 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  27.79 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1139  M16 family peptidase  24.5 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  26.43 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  25.3 
 
 		 514 aa  124  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  29.62 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  25.89 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0119  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase)  24.14 
 
 		 413 aa  124  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.369766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>