97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3744 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3653  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  71.6 
 
 		 517 aa  761    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3744  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  100 
 
 		 573 aa  1200    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0972  cytochrome c552  37.25 
 
 		 466 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2735  cytochrome c552  37.4 
 
 		 472 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0844  cytochrome c552  37.4 
 
 		 466 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000415815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0648  cytochrome c552  37.65 
 
 		 467 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0169797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2432  cytochrome c552  37.07 
 
 		 477 aa  302  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4315  cytochrome c552  36.47 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0931  cytochrome c552  37.17 
 
 		 466 aa  301  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4532  cytochrome c552  36.47 
 
 		 478 aa  300  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4626  cytochrome c552  36.47 
 
 		 478 aa  300  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03942  nitrite reductase, formate-dependent, cytochrome  36.47 
 
 		 478 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3957  cytochrome c552  36.47 
 
 		 478 aa  300  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4591  cytochrome c552  36.47 
 
 		 478 aa  300  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03902  hypothetical protein  36.47 
 
 		 478 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3922  formate-dependent cytochrome c nitrite reductase, c552 subunit  36.47 
 
 		 478 aa  300  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4536  cytochrome c552  36.79 
 
 		 478 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490866  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0658  cytochrome c552  37.81 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.034848  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5575  cytochrome c552  36.47 
 
 		 478 aa  299  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0831  cytochrome c552  38.45 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.01441  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4529  cytochrome c552  36.79 
 
 		 478 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4671  cytochrome c552  36.79 
 
 		 478 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3363  cytochrome c552  37.47 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.328864  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0659  cytochrome c552  37.47 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000892238  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4620  cytochrome c552  36.4 
 
 		 478 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal  0.388303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4622  cytochrome c552  36.4 
 
 		 478 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2812  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  37.22 
 
 		 466 aa  295  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3980  cytochrome c552  36.33 
 
 		 467 aa  293  8e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0622  cytochrome c552  37.88 
 
 		 463 aa  292  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0685  cytochrome c552  36.19 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000162376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3652  cytochrome c552  36.21 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00563536  hitchhiker  0.0000468517 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3834  cytochrome c552  36.21 
 
 		 467 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  normal  0.0322806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3711  cytochrome c552  36.21 
 
 		 467 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000131094  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0794  cytochrome c552  36.21 
 
 		 467 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00711776  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2363  cytochrome c552  35.41 
 
 		 477 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000178461  hitchhiker  0.000909202 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0688  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  33.73 
 
 		 464 aa  278  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02727  cytochrome c552  35.27 
 
 		 469 aa  277  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0505  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  34.15 
 
 		 452 aa  270  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003114  cytochrome c552 precursor  34.88 
 
 		 475 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1997  cytochrome c552  34.02 
 
 		 478 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3604  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  34.1 
 
 		 469 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.357303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1228  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  34.17 
 
 		 469 aa  263  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0609624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3036  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  34.3 
 
 		 469 aa  259  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.306753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0707  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  33.66 
 
 		 515 aa  241  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000210974  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1820  cytochrome c552  31.76 
 
 		 498 aa  235  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1101  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  31.67 
 
 		 488 aa  234  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3631  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  30.3 
 
 		 480 aa  181  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000140973  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1521  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  27.25 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2586  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  29.49 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00414644  normal  0.0377964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4234  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  29.13 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0701  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  27.31 
 
 		 427 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0963  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  28.75 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0960  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  28.75 
 
 		 490 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.230878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0910  respiratory nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming) precursor  28.33 
 
 		 490 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0529  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  27.46 
 
 		 401 aa  139  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0081  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  28.17 
 
 		 527 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.304883  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0964  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  26.82 
 
 		 515 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1490  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  26.97 
 
 		 529 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0955  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  27.59 
 
 		 489 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2097  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  28.22 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2385  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  28.17 
 
 		 524 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2333  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  27.88 
 
 		 524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114103 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1374  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  24.66 
 
 		 536 aa  124  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.661481  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1359  cytochrome c552  26.57 
 
 		 610 aa  117  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1546  cytochrome c552  26.42 
 
 		 610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.421407  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0341  cytochrome c552  26.22 
 
 		 610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0605023  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13420  formate-dependent nitrite reductase, periplasmic cytochrome c552 subunit  24.52 
 
 		 476 aa  110  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1244  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  26.94 
 
 		 607 aa  109  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08100  formate-dependent nitrite reductase, periplasmic cytochrome c552 subunit  23.97 
 
 		 485 aa  110  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  hitchhiker  0.0000000773325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0296  respiratory nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming) precursor  25.64 
 
 		 485 aa  107  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000171973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1980  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  24.34 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.439301 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1024  cytochrome c nitrite reductase, catalytic subunit NrfA  26.19 
 
 		 605 aa  103  9e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.140418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4608  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  25.11 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1042  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  25 
 
 		 482 aa  97.8  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0722076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2070  cytochrome c552  24.33 
 
 		 492 aa  97.1  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2150  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  23.41 
 
 		 492 aa  96.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2398  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  25.28 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3154  cytochrome c nitrite reductase, catalytic subunit NrfA, putative  24.81 
 
 		 490 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0211  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  22.85 
 
 		 483 aa  94  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000324038  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0129  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  25.07 
 
 		 557 aa  93.6  9e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2866  cytochrome c nitrite reductase  26.81 
 
 		 478 aa  92.8  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2929  cytochrome c552  24 
 
 		 483 aa  91.3  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1296  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  25.05 
 
 		 483 aa  90.9  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000757773 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1892  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  23.95 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000066915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1061  cytochrome c family protein  25.62 
 
 		 541 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.409799  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0665  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  24.07 
 
 		 484 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00225794  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2902  respiratory nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming) precursor  25.65 
 
 		 556 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0151335  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3705  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  23.38 
 
 		 513 aa  87.8  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2999  cytochrome c family protein  25.19 
 
 		 534 aa  87.4  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2987  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  25.39 
 
 		 557 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.1283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3092  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  25.13 
 
 		 557 aa  87  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2946  cytochrome c family protein  25.57 
 
 		 538 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0294  respiratory nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming) precursor  24.53 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000431436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4004  formate-dependent nitrite reductase periplasmic cytochrome c552 subunit-like protein  24.57 
 
 		 536 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00066664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0357  cytochrome c family protein  25.57 
 
 		 533 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.412865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1277  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  25.66 
 
 		 538 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1200  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  23.95 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.849928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>