More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3636 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  43.74 
 
 
1142 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  40.93 
 
 
807 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  44.43 
 
 
781 aa  685    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
765 aa  1593    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  41.44 
 
 
803 aa  628  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  40.46 
 
 
1148 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  40.83 
 
 
803 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  40.85 
 
 
820 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  39.72 
 
 
1155 aa  603  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.01 
 
 
1138 aa  592  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  27.66 
 
 
729 aa  246  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 
789 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  26.26 
 
 
821 aa  207  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.56 
 
 
942 aa  206  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  25.43 
 
 
910 aa  206  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3471  molybdopterin oxidoreductase  25.58 
 
 
778 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.26 
 
 
864 aa  201  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  25.74 
 
 
818 aa  202  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.37 
 
 
826 aa  201  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  23.55 
 
 
971 aa  199  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0507  molydopterin dinucleotide-binding region  23.77 
 
 
952 aa  197  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.485596  normal  0.607063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  26.15 
 
 
817 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  24.83 
 
 
800 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3264  Nitrate reductase  25.93 
 
 
836 aa  196  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0520925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0471  molydopterin dinucleotide-binding region  27.45 
 
 
1017 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.12 
 
 
824 aa  195  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  26.74 
 
 
817 aa  192  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  25.62 
 
 
839 aa  191  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  24.81 
 
 
851 aa  189  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
784 aa  189  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  25.87 
 
 
747 aa  187  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  25.34 
 
 
800 aa  187  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  29.4 
 
 
1139 aa  183  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05080  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.49 
 
 
857 aa  181  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1011  molybdopterin oxidoreductase  22.99 
 
 
787 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0550449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  26 
 
 
805 aa  180  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.97 
 
 
836 aa  179  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  28.79 
 
 
1143 aa  178  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  25.06 
 
 
744 aa  178  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  25.28 
 
 
969 aa  177  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  26 
 
 
805 aa  177  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  24.75 
 
 
898 aa  176  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07940  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.6 
 
 
834 aa  176  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379038 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  31.96 
 
 
700 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  25.27 
 
 
777 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2405  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 
804 aa  175  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0154144  normal  0.420011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  36.76 
 
 
698 aa  173  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  25.66 
 
 
856 aa  172  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3051  molybdopterin oxidoreductase  24.5 
 
 
822 aa  171  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333722  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.12 
 
 
953 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 
911 aa  168  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  23.31 
 
 
812 aa  168  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  24.28 
 
 
876 aa  167  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  23.71 
 
 
917 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  24.31 
 
 
858 aa  165  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  28.6 
 
 
711 aa  164  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.92 
 
 
893 aa  164  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 
974 aa  163  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  28.24 
 
 
739 aa  163  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  23.51 
 
 
833 aa  163  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27730  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.44 
 
 
801 aa  162  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.953321  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  24.59 
 
 
758 aa  162  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  26.49 
 
 
974 aa  161  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  30.32 
 
 
1055 aa  161  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  24.25 
 
 
760 aa  160  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  35.51 
 
 
692 aa  160  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  25.12 
 
 
981 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  25.68 
 
 
978 aa  159  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22740  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.89 
 
 
1053 aa  159  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.945653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  29.18 
 
 
694 aa  159  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.56 
 
 
793 aa  158  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  24.33 
 
 
703 aa  158  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.46 
 
 
792 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  24 
 
 
961 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1588  molydopterin dinucleotide-binding region  23.32 
 
 
945 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0385421 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  25.96 
 
 
978 aa  156  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  25.43 
 
 
666 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  25.72 
 
 
978 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.46 
 
 
792 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.46 
 
 
792 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.46 
 
 
792 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  25.2 
 
 
979 aa  155  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  25.98 
 
 
909 aa  154  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16890  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.42 
 
 
1018 aa  154  8e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.59 
 
 
792 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0290  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.81 
 
 
781 aa  152  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00528785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  28.21 
 
 
1135 aa  150  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.31 
 
 
1016 aa  150  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.96 
 
 
981 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2584  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  23.28 
 
 
927 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.822778  normal  0.769168 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  28.57 
 
 
685 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  23.67 
 
 
776 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.28 
 
 
974 aa  147  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  24.2 
 
 
866 aa  146  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0497  molydopterin dinucleotide-binding region  31.21 
 
 
1102 aa  146  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.64 
 
 
978 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.16 
 
 
978 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  26.67 
 
 
745 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  24.16 
 
 
973 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  24.64 
 
 
973 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>