100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3588 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  56.92 
 
 		 716 aa  793    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  100 
 
 		 745 aa  1556    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  67.15 
 
 		 729 aa  1008    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  39.65 
 
 		 738 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  37.98 
 
 		 735 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  38.6 
 
 		 741 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  37.52 
 
 		 722 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  37.85 
 
 		 727 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  37.45 
 
 		 729 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  37.37 
 
 		 725 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  36.95 
 
 		 731 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  37.43 
 
 		 724 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  37.73 
 
 		 731 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  37.12 
 
 		 730 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  37.03 
 
 		 745 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  37.25 
 
 		 730 aa  429  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  36.99 
 
 		 730 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  35.82 
 
 		 719 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  35.73 
 
 		 724 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  35.32 
 
 		 720 aa  405  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  25.92 
 
 		 639 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  25.53 
 
 		 639 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  30.34 
 
 		 822 aa  145  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  25.03 
 
 		 639 aa  145  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  25.72 
 
 		 639 aa  143  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  25.17 
 
 		 639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  25.26 
 
 		 639 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  24.69 
 
 		 639 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  24.9 
 
 		 639 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  29.63 
 
 		 843 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  24.44 
 
 		 833 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  24.41 
 
 		 639 aa  125  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  24.82 
 
 		 639 aa  115  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  24.08 
 
 		 646 aa  112  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  24.59 
 
 		 650 aa  108  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  24.46 
 
 		 650 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  23.79 
 
 		 820 aa  108  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  23.97 
 
 		 650 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  23.97 
 
 		 650 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  24.23 
 
 		 650 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  23.97 
 
 		 650 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  27.92 
 
 		 656 aa  103  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  27.9 
 
 		 898 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  24.21 
 
 		 640 aa  102  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  28.01 
 
 		 898 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  28.01 
 
 		 898 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  23.2 
 
 		 782 aa  98.2  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  23.53 
 
 		 714 aa  96.3  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  25.62 
 
 		 778 aa  94.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  31.13 
 
 		 826 aa  94.4  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 663 aa  94.4  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  25.22 
 
 		 788 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  24.43 
 
 		 755 aa  92  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  24.27 
 
 		 764 aa  91.7  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  23.15 
 
 		 757 aa  91.3  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  22.41 
 
 		 885 aa  90.9  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  22.81 
 
 		 671 aa  90.1  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  25.06 
 
 		 789 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  25.77 
 
 		 893 aa  88.6  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  21.04 
 
 		 789 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  23.27 
 
 		 770 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  24.12 
 
 		 788 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  24.77 
 
 		 653 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  24.84 
 
 		 762 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  25 
 
 		 809 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  22.21 
 
 		 657 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  24.1 
 
 		 762 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  25.16 
 
 		 895 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  22.64 
 
 		 742 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  22.38 
 
 		 655 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  24.02 
 
 		 667 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.8 
 
 		 766 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  20.61 
 
 		 764 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  26.79 
 
 		 741 aa  68.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  22.55 
 
 		 656 aa  66.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  23.63 
 
 		 762 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  23.53 
 
 		 762 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  21.99 
 
 		 785 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  27.69 
 
 		 761 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  27.69 
 
 		 761 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  26.2 
 
 		 731 aa  63.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  22.78 
 
 		 742 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  22.83 
 
 		 742 aa  61.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  27.3 
 
 		 764 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  27.23 
 
 		 680 aa  60.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  23.31 
 
 		 671 aa  59.7  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  27.3 
 
 		 764 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  23.29 
 
 		 936 aa  59.3  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  24.6 
 
 		 816 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  26.87 
 
 		 655 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  27.05 
 
 		 700 aa  52.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  24.49 
 
 		 945 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  25.07 
 
 		 696 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  25.81 
 
 		 758 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1111 aa  48.9  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  26.11 
 
 		 642 aa  48.5  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.68 
 
 		 754 aa  47.4  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  26.83 
 
 		 677 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  23.33 
 
 		 696 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  52.38 
 
 		 600 aa  44.3  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>