219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3558 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 		 201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  69.79 
 
 		 207 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  63.48 
 
 		 201 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  59.12 
 
 		 198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  52.24 
 
 		 203 aa  203  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  46.11 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  48.3 
 
 		 242 aa  157  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  45.16 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  42.61 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  43.89 
 
 		 189 aa  144  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  44.71 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  40.56 
 
 		 203 aa  137  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  43.37 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  40.22 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  31.77 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  36.02 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  33.88 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  38.99 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  35.88 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  35.83 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  32.34 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  34.24 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  34.88 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.05 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  35.8 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1485  arylesterase  34.68 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  33.91 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  32.14 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  36.31 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  34.13 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  34.45 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  37.87 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  36.67 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  31.07 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.28 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.05 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  31.82 
 
 		 219 aa  72  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  33.96 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  33.71 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  30 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  31.55 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  32.58 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  29.73 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.74 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.74 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.74 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.74 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  32.04 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.74 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  39.26 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  36.63 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  33.94 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  32.04 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  30.41 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  32.7 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.14 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  31.84 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2785  arylesterase  32.08 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.761375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  29.94 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  30.94 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  32.34 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  32.34 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  32.34 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  32.08 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  32.08 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  32.56 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0968  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.14 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.76 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  32.57 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  31.28 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  34.76 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  30.72 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  32.26 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  31.68 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3005  Lysophospholipase  31.98 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.890244  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  29.34 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04660  acyl-CoA thioesterase I  28.98 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0171424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  32.2 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  31.67 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  34.2 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  29.34 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.18 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118083  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  32.68 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  30.59 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0598  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.79584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3193  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  30.59 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.194164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2403  arylesterase  30.6 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  32.26 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  31.61 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  31.43 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  30.36 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>