279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3524 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  100 
 
 		 331 aa  689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  84.59 
 
 		 331 aa  588  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  70.21 
 
 		 331 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  49.08 
 
 		 332 aa  352  5e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  49.69 
 
 		 332 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  36.17 
 
 		 374 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  36.11 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  36.11 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  35.8 
 
 		 376 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  36.5 
 
 		 393 aa  222  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  36.89 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0321  adenosine deaminase  35.58 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.949208  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1214  adenosine deaminase  35.19 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  33.33 
 
 		 359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05460  adenosine deaminase  32.63 
 
 		 363 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  32.6 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  32.02 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2563  adenosine deaminase  30.84 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0538  adenosine deaminase  32.31 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000801372  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1406  adenosine deaminase  32.83 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000107989  hitchhiker  2.2737200000000002e-26 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0831  adenosine deaminase  31.27 
 
 		 360 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.557389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  32.02 
 
 		 333 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  32.02 
 
 		 333 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  31.76 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  32.33 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  32.33 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  32.33 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  32.33 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  32.33 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  31.83 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  32.33 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  31.83 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  32.33 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  32.02 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2936  adenosine deaminase  31.34 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000510583  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0759  adenosine deaminase  30.42 
 
 		 364 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  32.93 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1259  adenosine deaminase  31.53 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13344  adenosine deaminase  32.62 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.359069 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0791  adenosine deaminase  32.42 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1145  adenosine deaminase  30.92 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.605319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  32.02 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0815  adenosine deaminase  30.89 
 
 		 364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.407539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1233  adenosine deaminase  31.23 
 
 		 362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1250  adenosine deaminase  31.23 
 
 		 362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  31.97 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  30.15 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3533  adenosine deaminase  33.54 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0451471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1218  adenosine deaminase  32.77 
 
 		 378 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000911946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  30.4 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25670  adenosine deaminase  32.22 
 
 		 358 aa  169  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.362807  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4841  adenosine deaminase  31.45 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1002  adenosine deaminase  30.88 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  28.12 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1320  adenosine deaminase  31.1 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0285514  normal  0.854573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  28.57 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3935  adenosine deaminase  31.53 
 
 		 372 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0943553  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1362  adenosine deaminase  30.75 
 
 		 360 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1592  adenosine deaminase  31.23 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0478787  normal  0.265955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3954  adenosine deaminase  30.84 
 
 		 365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  30.77 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1781  adenosine deaminase  29.76 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  30.25 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  28.75 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  30.77 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0976  adenosine deaminase  30.86 
 
 		 375 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0686  adenosine deaminase  30.15 
 
 		 366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1770  adenosine deaminase  34.08 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  30.58 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1162  adenosine deaminase  30.83 
 
 		 402 aa  162  8.000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04960  adenosine deaminase  30.66 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.567283  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  30.58 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  29.94 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  29.94 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  30.34 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  29.63 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  29.63 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1027  adenosine deaminase  30.97 
 
 		 371 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  29.75 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  28.75 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  29.82 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  29.88 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  29.94 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  29.32 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  29.54 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4395  adenosine deaminase  31.94 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  29.32 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  28.79 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  29.01 
 
 		 331 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  29.01 
 
 		 331 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0789  adenosine deaminase  31.38 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0440  adenosine deaminase  32.22 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  29.32 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  26.91 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  29.66 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  26.93 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  25.93 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  26.71 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  27.08 
 
 		 366 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.151599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>