More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3407 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 266 aa  548  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  80.08 
 
 		 266 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  71.8 
 
 		 266 aa  394  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  72.73 
 
 		 262 aa  391  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  67.56 
 
 		 269 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  68.77 
 
 		 266 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  66.79 
 
 		 269 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  68.38 
 
 		 269 aa  374  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  68.38 
 
 		 269 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  66.92 
 
 		 268 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  68.6 
 
 		 269 aa  361  8e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  65 
 
 		 272 aa  360  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  66.41 
 
 		 269 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  66.03 
 
 		 269 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  66.03 
 
 		 269 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  65.65 
 
 		 269 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  59.07 
 
 		 263 aa  294  9e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  58.57 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  61.21 
 
 		 263 aa  281  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  54.83 
 
 		 265 aa  280  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  52.42 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  49.42 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  51.88 
 
 		 293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  55.08 
 
 		 255 aa  251  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  50.19 
 
 		 271 aa  234  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  47.43 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  43.68 
 
 		 268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  44.53 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  50.24 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  42.86 
 
 		 270 aa  198  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0007  hypothetical protein  41.13 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0007  peptidase M48 Ste24p  41.13 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  37.65 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  43.1 
 
 		 264 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  39.06 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  37.26 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  41.87 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  37.17 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  36.98 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  37.22 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  35.93 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  39.92 
 
 		 320 aa  168  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  35.34 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  34.94 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  39.73 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  36.51 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  35.07 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  34.72 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  38.26 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  37.08 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  33.72 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  36.8 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  33.98 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  35.02 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 		 271 aa  152  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  34.66 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  35.37 
 
 		 267 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  33.72 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  35.93 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  35.5 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  35.64 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  34.29 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  32.71 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  32.92 
 
 		 270 aa  145  9e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  35.34 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  33.99 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  35.27 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  34.08 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  34.46 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  36.86 
 
 		 273 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  34.32 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  34.32 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  32.97 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  33.46 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  36.44 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  40.35 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  35.27 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  34.29 
 
 		 340 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  31.06 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  40.11 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 		 298 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  36.71 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  33.86 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  31.3 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  35.83 
 
 		 423 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  39.77 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  35.1 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  32.45 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  34.78 
 
 		 489 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  38.07 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  35.94 
 
 		 489 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  35.78 
 
 		 489 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  36.2 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  30.33 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  36.1 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  36.84 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  32.91 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  32.46 
 
 		 494 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  33.51 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>