More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3391 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  92.72 
 
 		 151 aa  296  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  86.25 
 
 		 161 aa  296  9e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  86.09 
 
 		 151 aa  278  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  82.12 
 
 		 151 aa  259  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  74.39 
 
 		 165 aa  256  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  80.13 
 
 		 151 aa  254  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  79.47 
 
 		 151 aa  253  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  79.47 
 
 		 151 aa  251  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  79.47 
 
 		 151 aa  251  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  78.81 
 
 		 151 aa  250  6e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  79.47 
 
 		 151 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  79.47 
 
 		 151 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  79.47 
 
 		 151 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  79.47 
 
 		 151 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  71.52 
 
 		 151 aa  236  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  55.92 
 
 		 165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  54.97 
 
 		 153 aa  180  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  54.97 
 
 		 151 aa  178  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  56.95 
 
 		 151 aa  178  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  54.55 
 
 		 154 aa  177  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  56.95 
 
 		 151 aa  174  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  48.24 
 
 		 191 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  52.6 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  52.6 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  52.32 
 
 		 152 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  54.3 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  51.95 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  51.95 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  51.66 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  51.66 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  51.66 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  51.66 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  51.66 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  51.66 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  50.99 
 
 		 151 aa  167  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  50.99 
 
 		 150 aa  167  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  52.74 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  52.74 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  51.59 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  50.99 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  50.99 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  50.99 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  50.96 
 
 		 169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  50.96 
 
 		 169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  49.01 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  49.01 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  49.01 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  54.48 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  49.01 
 
 		 150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  53.19 
 
 		 140 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  52.05 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  52.48 
 
 		 140 aa  158  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  46.78 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  53.1 
 
 		 152 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  48.41 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  51.7 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  50.35 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  46 
 
 		 151 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  52.08 
 
 		 145 aa  151  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  48.34 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  45.39 
 
 		 153 aa  150  8e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  44.37 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  48.23 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  45.83 
 
 		 152 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  45.14 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  42.68 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  40.4 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  44.14 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  41.5 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  44.83 
 
 		 153 aa  127  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  40.56 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  40.69 
 
 		 151 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  37.25 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  42.95 
 
 		 196 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  40.28 
 
 		 150 aa  117  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  44.68 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0155  hypothetical protein  42.21 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0067  hypothetical protein  40.62 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0201  hypothetical protein  44.3 
 
 		 215 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0967046  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0072  hypothetical protein  40.62 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  36.59 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0177  hypothetical protein  43.62 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.020604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  44.53 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  36.91 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  36.3 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  37.14 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  36.36 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  34.15 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  40.85 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  36.42 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  36.81 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  35.92 
 
 		 158 aa  98.6  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  35.8 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  34.42 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  35.95 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  36.18 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  40.98 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  36.43 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>