248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3383 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3383  lipoprotein NlpI  100 
 
 		 302 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  hitchhiker  0.00207102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  87.5 
 
 		 302 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2821  lipoprotein NlpI  78.62 
 
 		 296 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125409  hitchhiker  0.000291055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3054  lipoprotein NlpI  73.97 
 
 		 297 aa  455  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000578899  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1032  lipoprotein NlpI  69.26 
 
 		 300 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967145  hitchhiker  0.000000287221 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1097  lipoprotein NlpI  68.92 
 
 		 300 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00121066  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1036  lipoprotein NlpI  69.26 
 
 		 300 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000294547  hitchhiker  0.00000000262651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2828  lipoprotein NlpI  69.7 
 
 		 301 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000420478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3274  lipoprotein NlpI  68.58 
 
 		 300 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000163193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1210  lipoprotein NlpI  68.24 
 
 		 300 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1134  lipoprotein NlpI  67.67 
 
 		 300 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00238055  unclonable  0.00000000000409261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3411  lipoprotein NlpI  67.67 
 
 		 300 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00436122  hitchhiker  0.000788701 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3233  lipoprotein NlpI  67.33 
 
 		 300 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000825968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0996  lipoprotein NlpI  70.73 
 
 		 303 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00555439  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1020  lipoprotein NlpI  71.43 
 
 		 298 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000492811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0967  lipoprotein NlpI  59.45 
 
 		 301 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.095502  hitchhiker  0.00485929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2208  lipoprotein NlpI  47.89 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0791  lipoprotein NlpI  43.99 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0277627  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01845  lipoprotein NlpI  44.27 
 
 		 269 aa  247  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0813  lipoprotein NlpI  44.81 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0590  lipoprotein NlpI  44.44 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03030  hypothetical protein  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0542  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.622793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3459  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3636  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02981  hypothetical protein  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4482  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3645  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3468  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3725  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.38632  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3574  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3355  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3537  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3468  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4000  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.825215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3591  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0535  lipoprotein NlpI  44.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03392  lipoprotein NlpI  43.71 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0494  lipoprotein NlpI  43.7 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0212481  normal  0.630766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3460  lipoprotein NlpI  43.01 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3608  lipoprotein NlpI  43.7 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002614  lipoprotein nlpI precursor  43.36 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3600  lipoprotein NlpI  43.33 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3341  lipoprotein NlpI  43.01 
 
 		 294 aa  231  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0179  lipoprotein NlpI  40.61 
 
 		 303 aa  218  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2210  lipoprotein NlpI  38.49 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0603  lipoprotein NlpI  37.5 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.58 
 
 		 547 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.42 
 
 		 820 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 649 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  23.51 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 784 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.38 
 
 		 1056 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.38 
 
 		 632 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 634 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 988 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.04 
 
 		 1022 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.97 
 
 		 818 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  32.14 
 
 		 706 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.08 
 
 		 1056 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  35 
 
 		 462 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 236 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 1276 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.27 
 
 		 810 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 392 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 361 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 243 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 271 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1121 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.3 
 
 		 1694 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 878 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.73 
 
 		 542 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 3145 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.87 
 
 		 738 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.09 
 
 		 742 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 1421 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 1005 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 219 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.34 
 
 		 1034 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2246  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353905 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 		 2240 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.35 
 
 		 629 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.65 
 
 		 706 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  39.44 
 
 		 1979 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3839  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 326 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120659 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 594 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  32.5 
 
 		 581 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>