More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3317 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3465  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  79.41 
 
 
943 aa  1578    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1539  hypothetical protein  77.27 
 
 
529 aa  903    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  65.68 
 
 
944 aa  1328    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  72.7 
 
 
931 aa  1410    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  51.33 
 
 
989 aa  983    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  67.02 
 
 
938 aa  1334    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00727633  normal  0.0393451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2790  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  67.44 
 
 
938 aa  1338    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00120618  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2778  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  56.07 
 
 
955 aa  1131    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  65.96 
 
 
944 aa  1337    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2889  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  67.44 
 
 
938 aa  1342    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00315446  decreased coverage  0.00000356203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  67.51 
 
 
944 aa  1323    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
957 aa  1982    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1287  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  64.83 
 
 
941 aa  1313    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000172415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2422  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  59.41 
 
 
942 aa  1097    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0305723  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2759  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  68.09 
 
 
937 aa  1364    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000369969  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  65.89 
 
 
944 aa  1334    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2588  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.8 
 
 
931 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0841472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.49 
 
 
982 aa  455  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2337  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.83 
 
 
918 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225496  normal  0.289664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.99 
 
 
1001 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.67 
 
 
868 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126138  normal  0.134869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3942  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.09 
 
 
864 aa  301  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0662737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3558  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.12 
 
 
870 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3037  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.75 
 
 
847 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.3 
 
 
641 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3200  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.81 
 
 
861 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469727  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0133  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.73 
 
 
880 aa  251  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.82 
 
 
882 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0025  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.15 
 
 
838 aa  240  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.87 
 
 
845 aa  235  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3218  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.09 
 
 
822 aa  177  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4612  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.35 
 
 
870 aa  164  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  30.84 
 
 
691 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.69 
 
 
689 aa  118  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.95 
 
 
822 aa  118  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  29.81 
 
 
693 aa  117  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  27.24 
 
 
648 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.13 
 
 
660 aa  114  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.22 
 
 
631 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.82 
 
 
680 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.69 
 
 
824 aa  110  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.94 
 
 
686 aa  110  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.06 
 
 
692 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.43 
 
 
692 aa  108  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.38 
 
 
910 aa  108  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  25.31 
 
 
652 aa  108  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.28 
 
 
654 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1301  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.22 
 
 
678 aa  105  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.32869  normal  0.0583688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.06 
 
 
688 aa  104  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.85 
 
 
673 aa  104  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2242  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.28 
 
 
807 aa  103  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140093  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  25.62 
 
 
652 aa  103  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  28.41 
 
 
656 aa  103  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.63 
 
 
575 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.41 
 
 
652 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  25.26 
 
 
654 aa  102  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.8 
 
 
691 aa  101  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  27.68 
 
 
656 aa  101  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.04 
 
 
682 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  24.63 
 
 
654 aa  99.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.63 
 
 
654 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  24.63 
 
 
655 aa  99.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.12 
 
 
686 aa  98.2  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.72 
 
 
655 aa  98.2  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  24.57 
 
 
841 aa  96.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1987  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.89 
 
 
813 aa  97.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  24.14 
 
 
655 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.76 
 
 
630 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.7 
 
 
665 aa  95.5  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  23.56 
 
 
655 aa  93.2  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.98 
 
 
670 aa  93.2  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.42 
 
 
924 aa  92.8  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.65 
 
 
677 aa  92  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  26.54 
 
 
685 aa  91.3  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.05 
 
 
622 aa  89.7  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.38 
 
 
667 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.99 
 
 
588 aa  89  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  27.16 
 
 
646 aa  87.8  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  25.74 
 
 
648 aa  87.4  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.71 
 
 
840 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25 
 
 
697 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.62 
 
 
672 aa  87.4  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0490  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  25.8 
 
 
729 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.45 
 
 
708 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03778  hypothetical protein  28.73 
 
 
865 aa  86.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.59 
 
 
720 aa  86.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.01 
 
 
678 aa  85.9  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.53 
 
 
594 aa  86.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  24.83 
 
 
665 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.19 
 
 
716 aa  85.5  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.35 
 
 
666 aa  85.5  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.346688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.92 
 
 
656 aa  85.5  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.47 
 
 
820 aa  84.7  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.8 
 
 
705 aa  84.7  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.1 
 
 
674 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.39 
 
 
662 aa  84  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.82 
 
 
762 aa  83.2  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.92 
 
 
615 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  25.53 
 
 
657 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.43 
 
 
642 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>