109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3286 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  100 
 
 
714 aa  1495    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  27.62 
 
 
639 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  27.04 
 
 
639 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  26.7 
 
 
639 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  27.08 
 
 
639 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  26.29 
 
 
639 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  26.45 
 
 
639 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  26.65 
 
 
639 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  25.96 
 
 
639 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  27.52 
 
 
646 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  25.82 
 
 
639 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  27.59 
 
 
640 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  26.53 
 
 
639 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  24.84 
 
 
764 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  24.85 
 
 
663 aa  132  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  24.85 
 
 
785 aa  126  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  24.28 
 
 
745 aa  119  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  25.4 
 
 
656 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  23.88 
 
 
738 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  24.02 
 
 
716 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  22.63 
 
 
822 aa  115  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  28.8 
 
 
650 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  28.27 
 
 
650 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  25.1 
 
 
650 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  28.53 
 
 
650 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  22.86 
 
 
735 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  27.74 
 
 
650 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  28 
 
 
650 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  23.05 
 
 
725 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  24.22 
 
 
719 aa  103  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  23.48 
 
 
667 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  23.58 
 
 
729 aa  101  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  22.58 
 
 
720 aa  100  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  23.9 
 
 
727 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  22.6 
 
 
729 aa  98.6  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  24.28 
 
 
660 aa  98.2  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  22.98 
 
 
731 aa  95.1  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  23.72 
 
 
833 aa  95.1  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  23.74 
 
 
653 aa  94.4  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  21.63 
 
 
722 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  22.72 
 
 
745 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  23.3 
 
 
671 aa  91.3  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  22.35 
 
 
724 aa  90.9  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  23.66 
 
 
741 aa  87  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  22.41 
 
 
731 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  23.14 
 
 
820 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  22.17 
 
 
778 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  23.71 
 
 
656 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  23.36 
 
 
843 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  24.08 
 
 
655 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  22.18 
 
 
724 aa  77.4  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  22.38 
 
 
731 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  27.3 
 
 
898 aa  74.7  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  27.3 
 
 
898 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  27.3 
 
 
898 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  21.7 
 
 
782 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  22.5 
 
 
826 aa  72.4  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  23.43 
 
 
764 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  21.9 
 
 
764 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  24.14 
 
 
671 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  23.24 
 
 
764 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  23.24 
 
 
761 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  24.01 
 
 
696 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  23.24 
 
 
761 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  22.14 
 
 
895 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  22.56 
 
 
762 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  21.75 
 
 
755 aa  67  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  22.72 
 
 
762 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  22.75 
 
 
788 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  22.22 
 
 
789 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  21.69 
 
 
765 aa  63.9  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  22.7 
 
 
762 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  22.16 
 
 
757 aa  63.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  31.46 
 
 
655 aa  62.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  22.53 
 
 
788 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  29.77 
 
 
612 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  21.43 
 
 
766 aa  62  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  23.34 
 
 
696 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  21.89 
 
 
789 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  22 
 
 
758 aa  61.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  21.36 
 
 
742 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  21.98 
 
 
730 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  21.46 
 
 
742 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  21.98 
 
 
730 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  25.09 
 
 
687 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  21.91 
 
 
936 aa  59.3  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  21.76 
 
 
730 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  23.53 
 
 
657 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  23.21 
 
 
700 aa  58.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  23.81 
 
 
856 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  27.41 
 
 
885 aa  57  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  22.79 
 
 
770 aa  57  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  21 
 
 
742 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  21.61 
 
 
754 aa  55.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  23.38 
 
 
857 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  25.08 
 
 
642 aa  54.7  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  30.3 
 
 
809 aa  54.3  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  23.15 
 
 
741 aa  54.3  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  30.18 
 
 
677 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  23.11 
 
 
762 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>