More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3195 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  82.82 
 
 		 227 aa  394  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  81.06 
 
 		 227 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  77.43 
 
 		 238 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  77.23 
 
 		 237 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  52.7 
 
 		 230 aa  251  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  53.07 
 
 		 229 aa  237  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  53.43 
 
 		 231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 246 aa  231  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.1 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5302  ABC transporter related  52.7 
 
 		 234 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  49.28 
 
 		 214 aa  221  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1662  ABC transporter related  52.25 
 
 		 234 aa  221  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.822676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0433  ABC transporter related  56.02 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  50.23 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  50.25 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  49.08 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.4 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  45.54 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.82 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.85 
 
 		 230 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.39 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  45.25 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  46.61 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  46.02 
 
 		 228 aa  207  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  46.19 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.09 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  49.75 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  49.75 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  45.74 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.29 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  45.74 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  49.01 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  44.59 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  49.01 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.33 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  46.19 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.59 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.59 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  48.4 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  45.37 
 
 		 229 aa  205  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 226 aa  204  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.73 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 226 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  48.77 
 
 		 236 aa  204  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.13 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  46.6 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2904  ABC transporter-like protein  48.4 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.108903 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.2 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  48.29 
 
 		 233 aa  202  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  47.06 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  45.91 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  48.51 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  44.89 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 		 230 aa  201  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  46.4 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  44.59 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  45.41 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  47.73 
 
 		 243 aa  201  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  45.29 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  47.95 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  49.75 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  47.52 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  48.79 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.05 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  45.21 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  47.55 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  43.84 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  45.5 
 
 		 233 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  41.63 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  45.21 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  45.09 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  43.38 
 
 		 249 aa  198  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  46.82 
 
 		 715 aa  198  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 222 aa  198  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  48.74 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  45.7 
 
 		 235 aa  197  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  46.43 
 
 		 226 aa  198  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.05 
 
 		 237 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  47.78 
 
 		 240 aa  197  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  46.33 
 
 		 655 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6690  ABC transporter, ATPase subunit  43.81 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810231  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  45.58 
 
 		 565 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>