33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3173 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  83.72 
 
 		 215 aa  381  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000278112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  73.46 
 
 		 212 aa  329  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  71.16 
 
 		 216 aa  327  6e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  68.25 
 
 		 212 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  69.19 
 
 		 215 aa  318  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  68.72 
 
 		 215 aa  317  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  70.24 
 
 		 209 aa  317  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  68.72 
 
 		 215 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  68.72 
 
 		 215 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  69.19 
 
 		 212 aa  315  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  68.72 
 
 		 212 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  67.3 
 
 		 212 aa  310  9e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  68.25 
 
 		 212 aa  310  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  65.4 
 
 		 212 aa  304  7e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  67.3 
 
 		 213 aa  298  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  44 
 
 		 214 aa  188  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  43.56 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  40.7 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  31.58 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  29.41 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  30.16 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  30.89 
 
 		 223 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  28.34 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  29.63 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.286419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  29.84 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>