More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3143 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  86.98 
 
 		 653 aa  1111    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  75.65 
 
 		 648 aa  960    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  76.73 
 
 		 648 aa  1002    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  82.59 
 
 		 649 aa  1070    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  76.27 
 
 		 648 aa  994    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  100 
 
 		 649 aa  1288    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  72.35 
 
 		 649 aa  921    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  76.43 
 
 		 648 aa  984    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  83.2 
 
 		 649 aa  1086    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  76.12 
 
 		 648 aa  959    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  76.12 
 
 		 648 aa  959    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  71.27 
 
 		 650 aa  938    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  74.96 
 
 		 648 aa  922    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  76.43 
 
 		 648 aa  998    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  76.12 
 
 		 648 aa  972    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  48.71 
 
 		 657 aa  590  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  45.81 
 
 		 720 aa  570  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  45.23 
 
 		 655 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  43.84 
 
 		 654 aa  497  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  39.94 
 
 		 662 aa  475  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  40.5 
 
 		 661 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  40.5 
 
 		 661 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  40.39 
 
 		 674 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  39.29 
 
 		 652 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 		 659 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  39.91 
 
 		 656 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  40.57 
 
 		 660 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.39 
 
 		 654 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  39.6 
 
 		 660 aa  415  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  40.48 
 
 		 658 aa  412  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  38.01 
 
 		 666 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  41.01 
 
 		 659 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  39.25 
 
 		 668 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  39.52 
 
 		 661 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  39.1 
 
 		 678 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  40.12 
 
 		 659 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  39.82 
 
 		 663 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  39.82 
 
 		 663 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  38.54 
 
 		 661 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  39.1 
 
 		 668 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.85 
 
 		 680 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  39.45 
 
 		 667 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  38.67 
 
 		 667 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.72 
 
 		 669 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  39.1 
 
 		 668 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  39.1 
 
 		 668 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  39.6 
 
 		 666 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.72 
 
 		 669 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  39.72 
 
 		 669 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  39.25 
 
 		 670 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  39.44 
 
 		 661 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.72 
 
 		 669 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.72 
 
 		 669 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  39.25 
 
 		 670 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  39.72 
 
 		 669 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  39.97 
 
 		 659 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  39.14 
 
 		 664 aa  382  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  39.25 
 
 		 661 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  39.16 
 
 		 665 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  40.44 
 
 		 655 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  38.19 
 
 		 661 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  39.6 
 
 		 661 aa  363  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.34 
 
 		 579 aa  359  8e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  42.51 
 
 		 570 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 		 666 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  33.85 
 
 		 636 aa  342  1e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.93 
 
 		 697 aa  335  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.46 
 
 		 671 aa  333  9e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 		 666 aa  332  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  30.61 
 
 		 674 aa  330  4e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  32.93 
 
 		 672 aa  324  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 		 658 aa  323  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  34.96 
 
 		 665 aa  321  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 		 666 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0907  sodium/hydrogen exchanger  36.41 
 
 		 563 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  34.05 
 
 		 664 aa  319  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  38.9 
 
 		 574 aa  319  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 		 688 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  35.56 
 
 		 630 aa  309  9e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  35.02 
 
 		 624 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  36.8 
 
 		 595 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  33.11 
 
 		 624 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  35.39 
 
 		 630 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  35.96 
 
 		 568 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  36.33 
 
 		 593 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  34.94 
 
 		 597 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  33.33 
 
 		 631 aa  302  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  35.5 
 
 		 591 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  34.58 
 
 		 583 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 		 741 aa  299  9e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  38.53 
 
 		 597 aa  299  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  35.55 
 
 		 632 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  35.44 
 
 		 629 aa  298  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  34.57 
 
 		 601 aa  296  9e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  35.31 
 
 		 533 aa  295  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34.59 
 
 		 602 aa  296  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  29.7 
 
 		 682 aa  295  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  34.4 
 
 		 601 aa  295  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34.59 
 
 		 602 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  34.59 
 
 		 602 aa  295  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>