175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3064 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 
334 aa  681    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  64.86 
 
 
324 aa  401  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  60.67 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  55.43 
 
 
318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  60.67 
 
 
316 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  60.5 
 
 
320 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  57.71 
 
 
316 aa  319  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  55.64 
 
 
338 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  55.64 
 
 
338 aa  318  9e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  55.64 
 
 
338 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  55.25 
 
 
338 aa  316  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  54.48 
 
 
316 aa  299  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  50.19 
 
 
403 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  54.01 
 
 
339 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  50.21 
 
 
300 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  51.46 
 
 
375 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  36.02 
 
 
270 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  38.58 
 
 
266 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  31.33 
 
 
262 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  34.17 
 
 
266 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  34.17 
 
 
266 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  34.87 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  32.54 
 
 
307 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  32.14 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  31.22 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 
243 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  34.8 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  29.61 
 
 
242 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  31.71 
 
 
228 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  31.71 
 
 
228 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  31.71 
 
 
228 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  28.27 
 
 
245 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  30.49 
 
 
228 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  30.49 
 
 
228 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  30.49 
 
 
228 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  30.6 
 
 
255 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  28.49 
 
 
230 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  28.99 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  26.07 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  30.61 
 
 
233 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  28.78 
 
 
264 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  32.45 
 
 
252 aa  89.4  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  28.29 
 
 
260 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  28.73 
 
 
236 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  26.67 
 
 
238 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  35.11 
 
 
201 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  26.67 
 
 
238 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  29.01 
 
 
278 aa  86.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  30.37 
 
 
251 aa  86.3  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  27.69 
 
 
254 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  26.56 
 
 
251 aa  85.9  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  27.14 
 
 
268 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  30 
 
 
252 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  26.67 
 
 
238 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  30.35 
 
 
224 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  27.14 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  28.86 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  26.15 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  27.41 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  27.37 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  25.95 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  28.4 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  25.95 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  30.37 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1722  polar flagellar assembly protein FliH  31.29 
 
 
212 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  27.04 
 
 
209 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  28.95 
 
 
235 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  28.48 
 
 
213 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1722  polar flagellar assembly protein FliH  29.8 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2129  flagellar assembly protein H  27 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.30816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  26.63 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2134  flagellar assembly protein H  27 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271327 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1271  flagellar assembly protein H  27 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.640019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1148  flagellar assembly protein H  27 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  25.63 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2187  flagellar assembly protein H  28.14 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.528884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  25.95 
 
 
231 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  25.63 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  29.41 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  29.3 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  24.03 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  24.03 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  25 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0435  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.98 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00322204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  23.08 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  23.08 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  27.27 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3563  flagellar assembly protein FliH  22.03 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  30.86 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  24.86 
 
 
225 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  21.97 
 
 
207 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3836  flagellar assembly protein FliH  28.4 
 
 
238 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.739706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  25.75 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  25.12 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  26.01 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  26.92 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  22.93 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  25.64 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>