More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3050 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3050  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905912  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1382  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  96.25 
 
 		 303 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0481328  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1634  cobyrinic acid ac-diamide synthase  96.25 
 
 		 293 aa  552  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1298  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  94.2 
 
 		 293 aa  547  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.206017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  94.2 
 
 		 293 aa  547  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1358  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  94.2 
 
 		 293 aa  547  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  0.103677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  94.2 
 
 		 293 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.483613  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  93.52 
 
 		 293 aa  544  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0524451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  93.52 
 
 		 293 aa  544  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2560  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  93.52 
 
 		 293 aa  544  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.110554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3052  cobyrinic acid ac-diamide synthase  93.52 
 
 		 293 aa  544  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2910  cobyrinic acid ac-diamide synthase  93.52 
 
 		 293 aa  544  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  93.17 
 
 		 293 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0384925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  90.1 
 
 		 303 aa  532  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292285  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3211  flagellar biosynthetic protein FlhG  93.99 
 
 		 283 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1198  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  92.15 
 
 		 293 aa  529  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000520334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3031  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  73.85 
 
 		 288 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1518  flagellar biosynthetic protein FlhG  75.18 
 
 		 280 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02871  flagellar biosynthetic protein FlhG  73.67 
 
 		 288 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742055  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002831  flagellar synthesis regulator FleN  66.55 
 
 		 295 aa  391  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000517997  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03145  hypothetical protein  66.44 
 
 		 295 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1655  ParA family protein  68.07 
 
 		 313 aa  384  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000026019  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2291  flagellar biosynthesis protein FlhG (flagellar number regulator)  67.72 
 
 		 296 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.23 
 
 		 299 aa  346  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2156  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.66 
 
 		 308 aa  345  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.14 
 
 		 293 aa  341  7e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3873  flagellar synthesis regulator FleN  63.4 
 
 		 280 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45640  flagellar synthesis regulator FleN  63.4 
 
 		 280 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555509  normal  0.237681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.62 
 
 		 270 aa  332  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2806  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.13 
 
 		 276 aa  332  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.992955  normal  0.186543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.74 
 
 		 276 aa  328  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4342  flagellar number regulator FleN  61.98 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422536  normal  0.723195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.98 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44123  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.62 
 
 		 276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3911  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.6 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3668  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.6 
 
 		 277 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0704909  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  60.98 
 
 		 274 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.98 
 
 		 277 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  55.91 
 
 		 289 aa  321  8e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  55.91 
 
 		 289 aa  321  8e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.54 
 
 		 297 aa  301  7.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2165  flagellar number regulator FleN  58.02 
 
 		 279 aa  299  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0478  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.56 
 
 		 277 aa  295  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  50.57 
 
 		 280 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.04 
 
 		 274 aa  281  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1863  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.34 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0949609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00958  flagellar synthesis regulator FleN  53.58 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.275874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06208  flagellar synthesis regulator FleN  53.58 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.55 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.55 
 
 		 296 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  44.1 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.48 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.77 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.72 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.77 
 
 		 308 aa  234  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  43.87 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.76 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.58 
 
 		 310 aa  228  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.77 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  45.21 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  43.35 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.35 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.37 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.25 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.65 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.05 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.5 
 
 		 333 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.02 
 
 		 370 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.3 
 
 		 519 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.93 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.63 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.37 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.37 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3765  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.37 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3849  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.28 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000469993 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.31 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0557  flagellar synthesis regulator FleN, putative  37.66 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000258989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.87 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.93 
 
 		 295 aa  175  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  31.99 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.57 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.08 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  36.16 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.59 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.11 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.82 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0777217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  40.32 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.44 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000540188  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.84 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.84 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  36.15 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0651  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.83 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.37 
 
 		 294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1300  flagellar synthesis regulator FleN, putative  35.98 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49294  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.02 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.192036  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.9 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1928  flagellar biosynthesis switch protein  38.35 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.965527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0698  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.21 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.6397 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.95 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.51 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00471356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>