More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3046 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  73.92 
 
 		 747 aa  1059    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  57.16 
 
 		 747 aa  776    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  60.45 
 
 		 744 aa  825    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  61.53 
 
 		 714 aa  808    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  73.8 
 
 		 758 aa  1037    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  75.33 
 
 		 741 aa  1072    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  78.44 
 
 		 746 aa  1109    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  57.52 
 
 		 758 aa  768    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  73.95 
 
 		 746 aa  1040    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  75.13 
 
 		 741 aa  1072    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  58.38 
 
 		 754 aa  773    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 733 aa  1464    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  63.86 
 
 		 751 aa  889    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  80.05 
 
 		 733 aa  1126    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  49.87 
 
 		 715 aa  641    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  51.74 
 
 		 719 aa  694    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  57.36 
 
 		 691 aa  738    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  58.48 
 
 		 737 aa  771    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  57.43 
 
 		 785 aa  813    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  75.03 
 
 		 747 aa  1049    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  58.35 
 
 		 767 aa  801    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  59.14 
 
 		 739 aa  775    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  56 
 
 		 747 aa  775    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  72.79 
 
 		 734 aa  1002    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  59.87 
 
 		 744 aa  840    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  47.9 
 
 		 739 aa  654    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  61.28 
 
 		 754 aa  850    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  72.37 
 
 		 760 aa  1071    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  74.39 
 
 		 762 aa  1058    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  51.23 
 
 		 734 aa  689    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  75.73 
 
 		 736 aa  1068    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  57.5 
 
 		 745 aa  780    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  56.6 
 
 		 753 aa  760    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  57.24 
 
 		 748 aa  765    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  72.96 
 
 		 762 aa  1051    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  73.16 
 
 		 738 aa  1036    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  58.69 
 
 		 743 aa  791    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  74.71 
 
 		 759 aa  1051    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  61.07 
 
 		 723 aa  843    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  57.03 
 
 		 709 aa  754    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  62.7 
 
 		 748 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  48.78 
 
 		 650 aa  595  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  50.2 
 
 		 614 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  56.84 
 
 		 552 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  56.84 
 
 		 552 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  44.92 
 
 		 770 aa  388  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 		 770 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  43.06 
 
 		 769 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  45.31 
 
 		 803 aa  382  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 696 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  42.8 
 
 		 769 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  43.07 
 
 		 769 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  44.24 
 
 		 774 aa  372  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  43.95 
 
 		 785 aa  368  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  42.47 
 
 		 783 aa  367  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  46.12 
 
 		 770 aa  366  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 713 aa  366  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 691 aa  362  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  42.8 
 
 		 601 aa  362  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 		 687 aa  360  6e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 694 aa  359  9e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  45.07 
 
 		 681 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  45.71 
 
 		 677 aa  357  6.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 701 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  45.43 
 
 		 604 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 709 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  42.32 
 
 		 639 aa  354  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  45.43 
 
 		 603 aa  354  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 		 598 aa  354  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  33.01 
 
 		 707 aa  351  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 		 652 aa  348  2e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  33.47 
 
 		 681 aa  348  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 		 606 aa  348  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  33.47 
 
 		 704 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 		 673 aa  344  4e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 607 aa  343  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  31.4 
 
 		 667 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  31.27 
 
 		 667 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  31.27 
 
 		 667 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 635 aa  340  5e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 724 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  44.39 
 
 		 610 aa  340  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  31.04 
 
 		 670 aa  339  9e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.95 
 
 		 784 aa  339  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  31.27 
 
 		 670 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 702 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2993  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 712 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  34.86 
 
 		 674 aa  337  5e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 728 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 673 aa  336  7.999999999999999e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 725 aa  336  7.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 671 aa  336  9e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  32.19 
 
 		 672 aa  335  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  34.39 
 
 		 715 aa  335  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 702 aa  335  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 670 aa  334  4e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 		 674 aa  333  5e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  45.75 
 
 		 685 aa  333  6e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 732 aa  333  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  43.29 
 
 		 660 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>