More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2992 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 332 aa  686    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  37.16 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.41 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  38.46 
 
 		 313 aa  162  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  37.56 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  34.53 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.32 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 234 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 350 aa  119  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.44 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.28 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.93 
 
 		 241 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  32.96 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 308 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 242 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  32.92 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  30.17 
 
 		 237 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  31.47 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 		 303 aa  95.9  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.36 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 348 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.3 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 		 1171 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  26.14 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  29.36 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.07 
 
 		 341 aa  89  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1414  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.57 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.44 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  29.06 
 
 		 325 aa  85.9  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.13 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.13 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.13 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  36.13 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  31.07 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.13 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.13 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 		 581 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.45 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2677  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  25.95 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  28.15 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 146 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  38.61 
 
 		 102 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 1035 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 		 373 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 		 386 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 		 1739 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0314  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.06758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>