More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2950 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 347 aa  728    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  80.64 
 
 		 347 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  69.65 
 
 		 351 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  64.64 
 
 		 357 aa  454  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  49.86 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  48.4 
 
 		 344 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  45.73 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  45.77 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 314 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  41.84 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 		 250 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 1035 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.31 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 280 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 		 247 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.02 
 
 		 295 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.04 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  30.04 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.92 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 255 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 		 256 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.89 
 
 		 326 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 		 357 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 1250 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.59 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 		 255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  44.19 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.17 
 
 		 253 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  29.44 
 
 		 260 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  41.6 
 
 		 340 aa  109  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  37.21 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.5 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  49.07 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.08 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 310 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 		 777 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.65 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 280 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 663 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.98 
 
 		 266 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.98 
 
 		 266 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  30.98 
 
 		 266 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 230 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 249 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.39 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>