69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2934 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  257  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  75.37 
 
 		 135 aa  203  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  72.36 
 
 		 151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  60.98 
 
 		 141 aa  157  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  60.53 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  51.33 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  52.43 
 
 		 265 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  44.12 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  52.43 
 
 		 262 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  52.43 
 
 		 262 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  44.12 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  53.4 
 
 		 282 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  49.54 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  49.54 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  49.54 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  51.96 
 
 		 278 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  49.54 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  49.14 
 
 		 147 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  48.18 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  50.49 
 
 		 269 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  50.49 
 
 		 270 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  50.49 
 
 		 267 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  49.51 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  47.57 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  42.86 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  34.26 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  34.95 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  30.77 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  33.64 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  33.66 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  31.93 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  27.64 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2505  hypothetical protein  36.25 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  33.68 
 
 		 203 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  31.19 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  32.38 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  28.72 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  31.11 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  30.39 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  28.42 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  30.93 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  38.61 
 
 		 223 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  28.32 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  26.6 
 
 		 183 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  26.6 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  28.26 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  31.63 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  25.24 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  26.47 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  32.18 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  24.3 
 
 		 199 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  25.53 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  26.61 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  29.47 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  28.57 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  25.74 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  25.45 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  29.13 
 
 		 123 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  26.19 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  26.19 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  30.85 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  27.52 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  28.26 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  22.45 
 
 		 122 aa  40.8  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  32.39 
 
 		 184 aa  40.4  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  23.85 
 
 		 132 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  27.27 
 
 		 154 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  23.85 
 
 		 132 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>