More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2861 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  95.42 
 
 		 873 aa  1704    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 873 aa  1788    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  74.4 
 
 		 869 aa  1315    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  40.49 
 
 		 841 aa  588  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  40.09 
 
 		 843 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  40.24 
 
 		 842 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  40.56 
 
 		 836 aa  570  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  39.62 
 
 		 855 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  39.46 
 
 		 838 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  40.25 
 
 		 839 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  39.07 
 
 		 853 aa  557  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  40.21 
 
 		 855 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  38.93 
 
 		 853 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  38.93 
 
 		 853 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  38.93 
 
 		 853 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  39.07 
 
 		 853 aa  544  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  40.18 
 
 		 817 aa  534  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  35.73 
 
 		 904 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  35.64 
 
 		 904 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 904 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  35.03 
 
 		 907 aa  499  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  35.57 
 
 		 904 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  35.3 
 
 		 965 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 907 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 935 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 924 aa  461  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  42.11 
 
 		 709 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 897 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  33.4 
 
 		 912 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 981 aa  435  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 937 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 933 aa  428  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 930 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 930 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 930 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 		 901 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  32.54 
 
 		 936 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 935 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 935 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 935 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 966 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 953 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 938 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 966 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  31.33 
 
 		 966 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 957 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 952 aa  360  6e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 935 aa  355  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 951 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 946 aa  344  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 974 aa  343  7e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 947 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  29.55 
 
 		 914 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 1088 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 975 aa  333  6e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 967 aa  327  6e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 951 aa  324  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 987 aa  323  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 985 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 948 aa  319  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  30.23 
 
 		 929 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 944 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 944 aa  315  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 855 aa  311  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 891 aa  311  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 869 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 981 aa  307  5.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 852 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 969 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 882 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  27.42 
 
 		 961 aa  303  8.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 882 aa  302  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 847 aa  301  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 861 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 861 aa  299  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 861 aa  299  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 910 aa  296  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 875 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 886 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 892 aa  292  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 886 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 849 aa  289  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 871 aa  290  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 966 aa  287  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 976 aa  282  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 861 aa  281  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 857 aa  281  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 861 aa  280  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 894 aa  280  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 976 aa  280  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 861 aa  280  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 940 aa  279  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 922 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 924 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 924 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 924 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 1028 aa  274  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  28.35 
 
 		 827 aa  274  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 982 aa  273  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 964 aa  271  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>