126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2857 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2857  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000347655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2412  hypothetical protein  79.92 
 
 		 287 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00339272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1788  hypothetical protein  77.34 
 
 		 278 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2579  hypothetical protein  77.24 
 
 		 289 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00624438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2620  hypothetical protein  75.91 
 
 		 288 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000591272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1503  hypothetical protein  75.91 
 
 		 283 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310146  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1764  hypothetical protein  77.24 
 
 		 289 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0025937  normal  0.0109092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2695  hypothetical protein  76.49 
 
 		 289 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00011236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2386  hypothetical protein  77.78 
 
 		 289 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000122506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2240  hypothetical protein  75.18 
 
 		 278 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000381376  hitchhiker  0.000876549 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2307  hypothetical protein  76.34 
 
 		 300 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2008  hypothetical protein  72.83 
 
 		 279 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2331  hypothetical protein  71.38 
 
 		 279 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000989316  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1305  hypothetical protein  73.98 
 
 		 278 aa  431  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0297196  normal  0.064547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2259  hypothetical protein  71.01 
 
 		 279 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000651935  normal  0.545232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2450  hypothetical protein  71.01 
 
 		 279 aa  428  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00881658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2900  hypothetical protein  68.18 
 
 		 282 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01094  hypothetical protein  62.31 
 
 		 283 aa  364  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0997289  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1775  hypothetical protein  60.92 
 
 		 281 aa  353  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3108  hypothetical protein  60.31 
 
 		 283 aa  350  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2550  hypothetical protein  57.84 
 
 		 283 aa  335  5e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.446305  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2641  hypothetical protein  62.45 
 
 		 281 aa  331  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1554  hypothetical protein  54.68 
 
 		 280 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.220831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0989  hypothetical protein  54.96 
 
 		 276 aa  319  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2003  hypothetical protein  55.3 
 
 		 277 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2398  hypothetical protein  54.34 
 
 		 277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1305  hypothetical protein  54.37 
 
 		 291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2081  hypothetical protein  53.38 
 
 		 279 aa  311  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1837  hypothetical protein  55.31 
 
 		 284 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21580  hypothetical protein  55.68 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2852  hypothetical protein  53.64 
 
 		 281 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.972172  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3297  hypothetical protein  53.58 
 
 		 277 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.867164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3153  hypothetical protein  53.01 
 
 		 280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0753442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0291  protein of unknown function DUF692  56.11 
 
 		 282 aa  295  6e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3094  hypothetical protein  50.19 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1138  hypothetical protein  42.51 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2222  hypothetical protein  42.35 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2180  hypothetical protein  39.45 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2831  hypothetical protein  42.21 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1061  hypothetical protein  41.18 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3517  hypothetical protein  41.18 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.753401 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2208  hypothetical protein  39.06 
 
 		 287 aa  195  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3392  hypothetical protein  40.78 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4062  hypothetical protein  39.05 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3296  hypothetical protein  41.46 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0904  hypothetical protein  39.22 
 
 		 312 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3406  hypothetical protein  37.5 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4400  hypothetical protein  37.12 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0971  hypothetical protein  39.22 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1009  hypothetical protein  39.22 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0975  hypothetical protein  39.22 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4775  hypothetical protein  38.19 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0527  hypothetical protein  41.18 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.754891  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3694  hypothetical protein  38.13 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0410237 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0967  hypothetical protein  38.43 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3398  hypothetical protein  39.23 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0783117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3267  protein of unknown function DUF692  38.66 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5128  hypothetical protein  37.25 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1558  hypothetical protein  37.8 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.103302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1242  hypothetical protein  36.7 
 
 		 298 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.933604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4384  hypothetical protein  35.29 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0773  hypothetical protein  33.99 
 
 		 316 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.91386  normal  0.243423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2032  hypothetical protein  37.07 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0120  hypothetical protein  34.98 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1262  hypothetical protein  35.88 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.328602  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0587  hypothetical protein  36.72 
 
 		 313 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0642886  normal  0.716102 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4647  hypothetical protein  35.74 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0735  hypothetical protein  35.88 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2174  hypothetical protein  38.43 
 
 		 303 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2030  hypothetical protein  38.43 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5938  hypothetical protein  35.81 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1723  hypothetical protein  34.51 
 
 		 283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4790  hypothetical protein  36.02 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00353  hypothetical protein  33.09 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1430  hypothetical protein  37.55 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.51935  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0757  hypothetical protein  34.67 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20741  hypothetical protein  32.71 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0846  hypothetical protein  33.58 
 
 		 311 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0992  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002084  hypothetical protein  32.57 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1381  hypothetical protein  32.58 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0499971  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6305  hypothetical protein  32.58 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2190  hypothetical protein  33.59 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3066  hypothetical protein  35.38 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.37853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0712  hypothetical protein  32.95 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1029  hypothetical protein  32.58 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.752115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1607  hypothetical protein  33.85 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0732  hypothetical protein  32.95 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0704  hypothetical protein  32.16 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3130  hypothetical protein  30.91 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4684  hypothetical protein  32.96 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34246  normal  0.868171 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0303  hypothetical protein  31.69 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.371477 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0724  hypothetical protein  30.59 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1004  hypothetical protein  28.74 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2959  hypothetical protein  31.08 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0652339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2359  hypothetical protein  31.76 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4291  hypothetical protein  32.35 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4401  hypothetical protein  32.35 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02372  hypothetical protein  32.2 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357992  normal  0.0533117 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>