More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2844 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  78.8 
 
 		 437 aa  702    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  86.24 
 
 		 442 aa  760    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  83.18 
 
 		 440 aa  734    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  83.41 
 
 		 440 aa  737    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  91.06 
 
 		 436 aa  802    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  83.18 
 
 		 440 aa  734    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 436 aa  862    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  80.97 
 
 		 438 aa  685    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  82.72 
 
 		 441 aa  699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  83.72 
 
 		 439 aa  734    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  83.41 
 
 		 437 aa  731    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  83.18 
 
 		 437 aa  731    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  81.38 
 
 		 436 aa  720    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  82.95 
 
 		 440 aa  729    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  83.18 
 
 		 437 aa  728    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  79.95 
 
 		 437 aa  707    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  61.72 
 
 		 434 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  60.73 
 
 		 449 aa  531  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  61.72 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  61.1 
 
 		 434 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  61.58 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  61.4 
 
 		 447 aa  517  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  60.24 
 
 		 445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  61.95 
 
 		 448 aa  507  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  52.62 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  51.9 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  54.63 
 
 		 436 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  52.72 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  51.55 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  47.65 
 
 		 440 aa  390  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  50.6 
 
 		 411 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  50.74 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  50.49 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  50.49 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  50.25 
 
 		 409 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  50.74 
 
 		 411 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  50.99 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  50.74 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  50.49 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  51.23 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  50.49 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  50.25 
 
 		 411 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  46.89 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  49.6 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  49.6 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  49.6 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  47.82 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  47.04 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  47.57 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  47.33 
 
 		 444 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  45.48 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  47.57 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  47.78 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  45.63 
 
 		 432 aa  359  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  47.04 
 
 		 433 aa  358  8e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  47.04 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  44.44 
 
 		 409 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  45.54 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  49.33 
 
 		 417 aa  353  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  45.16 
 
 		 410 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  45.04 
 
 		 402 aa  315  8e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  45.68 
 
 		 451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01133  hypothetical protein  41.81 
 
 		 424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  41.75 
 
 		 413 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  40.71 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004292  proton/glutamate symport protein  42 
 
 		 424 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0413758  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1325  proton glutamate symport protein  41.47 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151644  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  43.8 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3781  sodium:dicarboxylate symporter  42.12 
 
 		 421 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549433  hitchhiker  0.000150842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0642  sodium:dicarboxylate symporter  41.06 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3378  sodium:dicarboxylate symporter  41.06 
 
 		 416 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033988 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  41.59 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  41.26 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3882  sodium:dicarboxylate symporter  41.04 
 
 		 424 aa  282  9e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0642  sodium:dicarboxylate symporter  41.06 
 
 		 416 aa  282  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000327788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  43.83 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  45.99 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0719  sodium:dicarboxylate symporter  41.44 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3727  sodium:dicarboxylate symporter  42.04 
 
 		 414 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3853  sodium:dicarboxylate symporter  42.04 
 
 		 414 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000161512 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  41.28 
 
 		 432 aa  280  5e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1353  excitatory amino acid transporter  40.91 
 
 		 427 aa  279  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3670  sodium:dicarboxylate symporter  41.79 
 
 		 414 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.200681 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1020  sodium--dicarboxylate symporter  42.13 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4004  proton/glutamate symporter, putative  41.29 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1194  hypothetical protein  38.67 
 
 		 444 aa  275  8e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  39.19 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0671  sodium:dicarboxylate symporter  42.29 
 
 		 414 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  39.19 
 
 		 481 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0595  sodium:dicarboxylate symporter  40.63 
 
 		 414 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.1634  normal  0.0311958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  39.26 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  39.06 
 
 		 417 aa  273  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  41.91 
 
 		 416 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  38.44 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  38.44 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  38.76 
 
 		 423 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  39.17 
 
 		 416 aa  269  8e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  38.75 
 
 		 417 aa  269  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  39.26 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>